24小时热门版块排行榜    

查看: 874  |  回复: 9
当前主题已经存档。
【有奖交流】积极回复本帖子,参与交流,就有机会分得作者 xiesanshao 的 22 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xiesanshao

木虫 (正式写手)

出来混,迟早要还的!记住!

[交流] 【求助】悬赏求助关于用MS-CASTEP计算晶体结构!

谁做过这类计算或懂这方面的东西,望不吝赐教!

看了文献报道(Nagaoka, M.; Ohta, Y.; Hitomi, H., Coordination Chemistry Reviews 2007, 251 (21-24), 2522-2536.)的运用castep模块计算配合物的电子结构以及吸附性能,我下载了个试了下发现如下问题:

1.castep计算配合物晶体结构这种周期性体系是不是要很多内存,我的体系大概是分子还有90个左右原子,每个原胞还有4个分子。每次不管怎么算都是Out of RAM for recip_beta_save in ion_beta_recip_set,我实在windows下做的计算用的ms4.3,我想问的是,是不是我的设置有问题(反正我按最小的那些值设的),如果添加内存能否解决问题,如果不能这种体系需要多大的计算性能(文献的计算参数附件
机子配置:core 2 E6300 2G DDR800 250g
2:castep在linux下的效率是不是远比windows高(如gaussian)。
3:如果我的还是这种体系是不是一定要用集群才能算,集群的话有什么要求!
4:如果有谁有条件能否帮我跑下这个任务!有兴趣的联系55479826@163.com,谢谢了!

[ Last edited by xiesanshao on 2008-9-11 at 11:28 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

天空的心,随风漂流!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aylayl08

荣誉版主 (文坛精英)

至尊天蝎

优秀版主

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xiesanshao(金币+5,VIP+0):K点的设置是不是对内存占用很多!但我的分子是90多个原子,但每个单胞含很多原子,计算量按单胞算还是按分子的原子算?
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
90多的原子倒不是大到离谱,只要设置正确,体系合理,单机算感觉也可以,再加内存吧,4G看看行不?如果集群弄不到的话。
珍惜拥有,快乐人生!欢迎光临计算模拟区(*^__^*)。。。。。。。。。。。。。。
4楼2008-09-10 20:43:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

hopingzmn

金虫 (知名作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xiesanshao(金币+5,VIP+0):谢谢,linux下是不是一定要两个机子,不能自己给自己提交?谢谢!
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
个人感觉你这个体系计算量很大,计算量通常和原子数的立方成正比
castep在linux下的效率比windows高,可以换个小型服务器试试,或者用集群,当然能够找到愿意合作的最好了
淡定
2楼2008-09-10 17:38:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

philonb

银虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
xiesanshao(金币+2,VIP+0):thank you,I have tried!
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
楼上说得对

但建议楼主可以先试试以下方法:
在job control里运行时间优化里选择memory,这样程序计算时比较节约内存,但是计算时间可能要稍微长些。
3楼2008-09-10 17:54:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xjz816

木虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
windows一般是32位的,支持最大内存3.2G,再大已经没有用了
建议用linux 64位系统或者集群
或者用dmol算试试,需要资源少点
心是一切行为的根本,以什么心做事,最终就会成就什么样的人
5楼2008-09-10 23:53:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 317一志愿华南理工电气工程求调剂 +4 Soliloquy_Q 2026-02-28 5/250 2026-02-28 22:49 by 布什戈们
[考研] 化工专硕348,一志愿985求调剂 +4 弗格个 2026-02-28 6/300 2026-02-28 22:00 by wang_dand
[考研] 292求调剂 +3 yhk_819 2026-02-28 3/150 2026-02-28 21:57 by gaoxiaoniuma
[考研] 290求调剂 +5 材料专硕调剂; 2026-02-28 6/300 2026-02-28 21:40 by gaoxiaoniuma
[考研] 295求调剂 +5 19171856320 2026-02-28 5/250 2026-02-28 21:39 by gaoxiaoniuma
[考博] 26申博 +4 想申博! 2026-02-26 4/200 2026-02-28 21:37 by limorning
[考研] 材料类求调剂 +6 wana_kiko 2026-02-28 6/300 2026-02-28 21:20 by gaoxiaoniuma
[基金申请] 面上模板改不了页边距吧? +5 ieewxg 2026-02-25 5/250 2026-02-28 20:11 by iwuli
[考研] 276求调剂 +3 路lyh123 2026-02-28 4/200 2026-02-28 19:45 by 路lyh123
[考博] 博士推荐 +5 花儿笑? 2026-02-21 6/300 2026-02-28 18:53 by nxgogo
[考研] 0856材料求调剂 +10 hyf hyf hyf 2026-02-28 11/550 2026-02-28 18:50 by 无际的草原
[教师之家] 版面费该交吗 +15 苹果在哪里 2026-02-22 18/900 2026-02-28 18:20 by mibaomingg
[考研] 285求调剂 +5 满头大汗的学生 2026-02-28 5/250 2026-02-28 18:10 by 材料专硕调剂;
[考研] 材料调剂 +3 爱擦汗的可乐冰 2026-02-28 3/150 2026-02-28 18:06 by houyaoxu
[考研] 0856调剂 +3 刘梦微 2026-02-28 3/150 2026-02-28 13:22 by houyaoxu
[考研] 寻找调剂 +3 LYidhsjabdj 2026-02-28 3/150 2026-02-28 12:59 by miniwendy
[考研] 304求调剂 +5 曼殊2266 2026-02-28 6/300 2026-02-28 12:44 by 迷糊CCPs
[硕博家园] 博士自荐 +6 科研狗111 2026-02-26 9/450 2026-02-28 12:32 by seaskyy
[考研] 272求调剂 +3 田智友 2026-02-28 3/150 2026-02-28 12:31 by 王加浩to
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
请填处理意见