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凌云志123

金虫 (正式写手)

[求助] 径向分布函数图解析 已有1人参与

我的径向分布是这个熊样，最后不是在1附近，而是直接下来了……是因我的截断半径设置问题吗？我的是11的立方格子，截断半径还没有超过这个数值啊，请大家帮我分析下，我刚上手分子动力学，大家多赐教

径向分布函数图解析
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1楼 2015-10-30 19:44:52
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WanderingHeart

铁杆木虫 (著名写手)
什么径向分布函数啊？
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2楼2015-10-30 21:41:02
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凌云志123

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by WanderingHeart at 2015-10-30 21:41:02
什么径向分布函数啊？

RDF或者pcf
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3楼2015-10-31 10:40:21
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
凌云志123: 金币+20 2016-03-18 16:12:33
这看起来基本是正常的，假如你计算rdf的程序没有问题的话。

你的立方体盒子边长只有10，由于周期性边界条件，符合rdf计算程序归一化条件的区域在r<10/2=5.0的区域内，所以可以看到在小于5.5的时候rdf值是接近1 的（rdf值在无穷远处会趋近于1）。当5.50< r < sqrt(2)*5.5时，这时可看做是统计边长为10的立方盒子砍去一个半径为5的内切球的剩余边角区域内的粒子，通常rdf计算程序在这一部分区域内的归一化会失效，所以你的rdf在5到7之间会从1掉到0.

一般r大于盒子边长一半的情况下rdf是没有太大意义的，画图时不必画出。
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4楼2015-10-31 14:39:08
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凌云志123

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lsloneil at 2015-10-31 14:39:08
这看起来基本是正常的，假如你计算rdf的程序没有问题的话。

你的立方体盒子边长只有10，由于周期性边界条件，符合rdf计算程序归一化条件的区域在r<10/2=5.0的区域内，所以可以看到在小于5.5的时候rdf值是接近 ...

你好，谢谢你的解答回复！也就是说程序会找到立方盒子中位于中央的粒子，然后以这个粒子为中心，R为径向的分布函数，是这个意思吗？

还有一个问题就是积分这个g（r）所得数值为所选中心粒子周围粒子的配位数，也就是可以理解为在所选定r的半径范围内的所有粒子数，我的计算体系在整个立方晶胞里面是96个原子，但是这样积分的结果大约是4，差别太大了，老师我的问题在哪？
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5楼2015-11-01 10:32:01
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 凌云志123 at 2015-10-31 14:32:01
你好，谢谢你的解答回复！也就是说程序会找到立方盒子中位于中央的粒子，然后以这个粒子为中心，R为径向的分布函数，是这个意思吗？

还有一个问题就是积分这个g（r）所得数值为所选中心粒子周围粒子的配位数，也 ...

"也就是说程序会找到立方盒子中位于中央的粒子，然后以这个粒子为中心，R为径向的分布函数，是这个意思吗？"
基本上是这个意思。实际情况是由于周期性边界条件的存在，程序是选取每一个粒子为中心，计算它周围R径向的分布函数，然后对所有粒子求平均。

计算配位数需要注意以下两点：
1. 你是否乘以了4*pi*r^2？
2. 你是否乘以了体系内所有粒子的平均密度？如果不明白我在说什么，请再看一遍计算配位数的公式。
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6楼2015-11-01 11:10:19
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凌云志123

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by lsloneil at 2015-11-01 11:10:19
"也就是说程序会找到立方盒子中位于中央的粒子，然后以这个粒子为中心，R为径向的分布函数，是这个意思吗？"
基本上是这个意思。实际情况是由于周期性边界条件的存在，程序是选取每一个粒子为中心，计算 ...

谢谢
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7楼2015-11-01 13:57:45
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匿名

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8楼2016-12-05 15:58:28
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