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凌云志123

金虫 (正式写手)

[求助] 径向分布函数图解析 已有1人参与

我的径向分布是这个熊样,最后不是在1附近,而是直接下来了……是因我的截断半径设置问题吗?我的是11的立方格子,截断半径还没有超过这个数值啊,请大家帮我分析下,我刚上手分子动力学,大家多赐教

径向分布函数图解析
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 凌云志123 at 2015-10-31 14:32:01
你好,谢谢你的解答回复!也就是说程序会找到立方盒子中位于中央的粒子,然后以这个粒子为中心,R为径向的分布函数,是这个意思吗?

还有一个问题就是积分这个g(r)所得数值为所选中心粒子周围粒子的配位数,也 ...

"也就是说程序会找到立方盒子中位于中央的粒子,然后以这个粒子为中心,R为径向的分布函数,是这个意思吗?"
基本上是这个意思。实际情况是由于周期性边界条件的存在,程序是选取每一个粒子为中心,计算它周围R径向的分布函数,然后对所有粒子求平均。

计算配位数需要注意以下两点:
1. 你是否乘以了4*pi*r^2?
2. 你是否乘以了体系内所有粒子的平均密度?如果不明白我在说什么,请再看一遍计算配位数的公式。
6楼2015-11-01 11:10:19
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WanderingHeart

铁杆木虫 (著名写手)

什么径向分布函数啊?
2楼2015-10-30 21:41:02
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凌云志123

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by WanderingHeart at 2015-10-30 21:41:02
什么径向分布函数啊?

RDF或者pcf
3楼2015-10-31 10:40:21
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
凌云志123: 金币+20 2016-03-18 16:12:33
这看起来基本是正常的,假如你计算rdf的程序没有问题的话。

你的立方体盒子边长只有10,由于周期性边界条件,符合rdf计算程序归一化条件的区域在r<10/2=5.0的区域内,所以可以看到在小于5.5的时候rdf值是接近1 的(rdf值在无穷远处会趋近于1)。当5.50< r < sqrt(2)*5.5时,这时可看做是统计边长为10的立方盒子砍去一个半径为5的内切球的剩余边角区域内的粒子,通常rdf计算程序在这一部分区域内的归一化会失效,所以你的rdf在5到7之间会从1掉到0.

一般r大于盒子边长一半的情况下rdf是没有太大意义的,画图时不必画出。
4楼2015-10-31 14:39:08
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