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gaven0728

新虫 (小有名气)

[求助] 用findit找到了x相晶包,导入ms中出错?? 已有1人参与

如题,首先用findit软件找到了我要的x相(Cr6Fe8Mo5),明显存在3种原子,如图1所示,然后将其保存为*.cif格式,再导入到ms中,结果显示只有Mo和Fe原子,Cr原子不见了,如图2所示。不知道怎么回事?后来想根据findit生成的txt文本中的晶格参数来自己建立晶包,但是发现原子坐标看不懂?求大神指导怎么看这个坐标,最好再帮忙用ms建个晶包。
下面是findit生成的txt文件信息。
*data for   ICSD #102758
CopyRight   ?2009 by Fachinformationszentrum Karlsruhe, and the U.S. Secretary of
            Commerce on behalf of the United States.  All rights reserved.
Coll Code   102758
Rec  Date   2004/10/01
Chem Name   Chromium Iron Molybdenum (6/18/5)
Structured  Cr6 Fe18 Mo5
Sum         Cr6 Fe18 Mo5
ANX         N5O24
D(calc)     8.41
Title       The ordering of atoms in the chi-phase of the Fe-Cr-Mo system
Author(s)   Kasper, J.S.
Reference   Acta Metallurgica
            (1954), 2, 456-461
Unit Cell   8.92 8.92 8.92 90. 90. 90.
Vol         709.73
Z           2
Space Group I -4 3 m
SG Number   217
Cryst Sys   cubic
Pearson     cI58
Wyckoff     g2 c a
R Value     .06
Red Cell    I  7.724 7.724 7.724 109.471 109.471 109.471 354.866
Trans Red   0.500 0.500 -0.500 / -0.500 0.500 0.500 / 0.500 -0.500 0.500
Comments    Neutron diffraction (powder)
            The structure has been assigned a PDF number (calculated
            powder diffraction data): 01-071-7541
            Structure type : Mn(cI58)
            At least one temperature factor missing in the paper.
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H
Cr   1  +0    24 g  0.356       0.356       0.042          0.375      0   
Fe   1  +0    24 g  0.356       0.356       0.042          0.625      0   
Cr   2  +0    24 g  0.089       0.089       0.278          0.125      0   
Fe   2  +0    24 g  0.089       0.089       0.278          0.875      0   
Mo   1  +0    2 a   0           0           0              1.         0   
Mo   2  +0    8 c   0.317       0.317       0.317          1.         0   
*end for    ICSD #102758

用findit找到了x相晶包,导入ms中出错??
1.jpg


用findit找到了x相晶包,导入ms中出错??-1
2.jpg
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gaven0728

新虫 (小有名气)

没人哇,自己顶下

发自小木虫IOS客户端
2楼2015-10-23 10:39:05
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-10-24 08:38:41
引用回帖:
2楼: Originally posted by gaven0728 at 2015-10-23 10:39:05
没人哇,自己顶下

x,y,z对应那三列就是坐标,直接在MS里面添加就行。或者可以试一试先把cif导入vesta,再导出为新的cif,再导入MS,多半就没问题了。
3楼2015-10-23 10:51:17
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一苇所如

新虫 (正式写手)

Sof不等1,表示该亚晶格不被该原子全部占有,是几个原子共同占据 ,这需要倒入后变换

发自小木虫Android客户端
4楼2015-10-23 11:35:59
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gaven0728

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xxxxxxxfc at 2015-10-23 10:51:17
x,y,z对应那三列就是坐标,直接在MS里面添加就行。或者可以试一试先把cif导入vesta,再导出为新的cif,再导入MS,多半就没问题了。...

Fe和Cr的x,y,z坐标一样,区分不了。导入vesta后也无法区分。
用findit找到了x相晶包,导入ms中出错??-2
3.jpg

5楼2015-10-23 17:02:26
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gaven0728

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 一苇所如 at 2015-10-23 11:35:59
Sof不等1,表示该亚晶格不被该原子全部占有,是几个原子共同占据 ,这需要倒入后变换

sof不等1,表示这个位子Fe和Cr都有可能占据,这个我知道。你说的需要导入后变换是怎么意思,怎么操作??我主要是做实验的,想拿ms算个几个参数,刚弄1个礼拜,所以麻烦解释详细点。非常感谢!!
6楼2015-10-23 17:05:55
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一苇所如

新虫 (正式写手)

你最好不要直接倒入,自己建就知道这么回事了

发自小木虫Android客户端
7楼2015-10-24 00:33:47
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anmin0127

至尊木虫 (知名作家)

8楼2015-10-24 00:37:18
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gaven0728

新虫 (小有名气)

自己建立的话,fe和cr的x,y,z一样,没法建立。我倒入后仔细看了下,fe和cr是混合原子,有百分比。对于这种混合原子的情况在后面结构优化及energy计算时应该怎么考虑呢?

发自小木虫IOS客户端
9楼2015-10-24 13:28:20
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-11-23 08:20:13
引用回帖:
5楼: Originally posted by gaven0728 at 2015-10-23 17:02:26
Fe和Cr的x,y,z坐标一样,区分不了。导入vesta后也无法区分。

3.jpg
...

那就导入MS后,再自己修改
10楼2015-10-26 08:39:32
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