应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Wien2k&FLAPW&ELK » WIEN2K K点并行问题
51/1返回列表
查看: 1430  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

fyuewen

金虫 (正式写手)

[求助] WIEN2K K点并行问题 已有2人参与

各位朋友好，WIEN2k买来几年，因为并不是主要的工具所以都一直在并行着，最近想算一个原子数多一些的模型，所以需要并行。

我打算先在一个老的服务器上用K点并行方式计算，mpif90, mkl等都是有的。

看官方手册的.mashines文件部分，说实话，并没有看明白它在.machines里面是按照何种规则写的。

The following .machines file describes a simple example. We assume to have 5 computers, (alpha,
... epsilon), where epsilon has 4, and delta and gamma 2 cpus. In addition, gamma, delta and
epsilon are 3 times faster than alpha and beta.:
# This is a valid .machines file
#
granularity:1
1:alpha
1:beta
3:gamma:2 delta epsilon
3:delta:4 epsilon:4
residue:delta:4
lapw0:gamma:2 delta:2 epsilon:4
dstart:gamma:2 delta:2 epsilon:4

问了南大的好朋友，他们是直接在.machine里面写了节点名称，我按照他们的方式，比如我想在c0109这个节点上计算，我就把.machines里面写了c0109和granularity:1，然后进入到c0109这个节点，run_lapw -p之后， LAPW0 END结束后程序就自己中断了，也没有给什么错误，但是也没有算完，十分费解。折腾了蛮久，希望哪位前辈能够指点一下。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
Physicsloveukulele!Aloha!
1楼 2015-10-21 20:15:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wilsun7

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2016-01-30 18:04:24
你的串行计算可以跑吗？测试过吗？并行编译都没什么报错是吧？

我粘贴一个我的.machines file:
granularity:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
extrafine:1

相应的把我的 c11-09 换成你的 c0109。 我的文件是用脚本在计算机中心上产生的，当然如果你不用提交作业就可以跑的话，就不用脚本。
赞一下 回复此楼
2楼2016-01-17 07:49:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangyuqi

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
3楼2016-01-17 11:37:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

迷路的游侠

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wilsun7 at 2016-01-17 07:49:30
你的串行计算可以跑吗？测试过吗？并行编译都没什么报错是吧？

我粘贴一个我的.machines file:
granularity:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-09:1
1:c11-0 ...

我的像你这样写程序能跑也能并行，但是并行总在登录节点上进行，不知道咋回事？以前好好的，太久没用了重装之后就这样了
就是例如：
granularity:1
1:c01:1
1:c01:1
1:c02:1
1:c02:1
extrafine:1
它不能分配到正确的节点上去并行，在哪儿登录就就在哪儿算...
赞一下 回复此楼
4楼2016-03-15 17:29:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

迷路的游侠

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你这个可能是lapw1算的慢还没出结果，然后你的shell和主机断开链接，导致中断，可以K点先少一点看能不能跑完一个流程。如果可以，那就把任务提交到后台，这样就不会因为shell的原因导致任务中断
赞一下 回复此楼
5楼2016-03-15 17:39:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fyuewen 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 10/500 2026-08-30 17:36 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 17:34 by hZiFeudZyoGR
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-30 17:03 by hZiFeudZyoGR
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-30 16:34 by xiangy672
[基金申请] 能否申诉？ +4 echo8914667 2026-08-30 4/200 2026-08-30 16:03 by sundiv
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 6/300 2026-08-30 13:54 by GkCVyODlx4mR
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:03 by l0VvVHGBGRLv
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +4 349506619 2026-08-28 4/200 2026-08-29 22:41 by alongwaytogo
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭