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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 用chembio3d将小分子进行MM2能量优化后，存为mol2文件,再用DS与蛋对接，对接不上
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liqing1910

木虫 (著名写手)

[求助] 用chembio3d将小分子进行MM2能量优化后，存为mol2文件,再用DS与蛋对接，对接不上 已有1人参与

用chembio3d将小分子进行MM2能量优化后，存为mol2文件,再用DS与蛋白对接，对接不上，而用DS将小分子进行优化后能够对接上，但是用两种不同方法优化后的分子结构差别挺大的，怎样能使chembio3d优化后的小分子能用DS与蛋白对接呢？

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做一个有用的小虫子
1楼 2015-10-20 21:45:52
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xiaomengyeyu

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

两者参数不一样，你可以先试试chemdraw3D再保存成mol2格式文件导到sybyl中再优化好一点

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知识的虫洞
2楼2015-12-20 00:24:11
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