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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » autogrid运行后生成的文件不全
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510王力宏

新虫 (初入文坛)

[求助] autogrid运行后生成的文件不全 已有1人参与

在运行autogrid后生成的文件不全，求解是怎么回事啊。原来做其他酶分子对接时并没有这个问题
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1楼 2015-10-20 21:37:28
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510王力宏

新虫 (初入文坛)
提示的错误是 I can't find or open "Acrylonitrile"     Acrylonitrile是我对接的小分子。我的所有文件都是和autodock程序在一个文件夹里的。应该不是路径问题。这个小分子是丙烯腈，难道是因为这个分子没有扭曲键就做不了吗？求助啊！！！！
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2楼2015-10-20 21:46:35
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爱学习的睿

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你把gpf中  ligand类型 和生成map文件与dpf中的保持一致就好了。因为 dpf中默认算的是6个。你要在gpf中把不足的加上，或者把dpf中多余的删除。
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3楼2016-01-29 10:14:16
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