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Anaya婧

新虫 (初入文坛)

[求助] 跪求!克隆基因启动子,用HI-TAILPCR测序多次结果都是非目的条带,请教各位大神原因!

先克隆了该基因的cDNA获得全长,然后克隆了该基因内含子,就中间不到200bp一段,跟拟南芥该基因一样,然后根据内含子前面500bp设计反向互补引物3条,间隔100左右,根据文章中要求,后两条计算后TM值均在68℃以上,tail的体系程序完全用的都是文章中的,引物是英潍捷基(上海)合成的,酶用的是诠释金的高保真的Pfu酶。克隆1年了,先前用的是武汉的FPNI-PCR方法,跟HI-TAIL原理类似,结果也都是非特异性条带,然后用HI-TAIL,结果也是非特异,想问下各位大神到底是哪里的问题!本人也是着急毕业啊!!跪谢!!!
(附:图片3个为一组,分别是2轮产物,3轮产物,和3轮普通PCR结果,选了红框里大于1000的条带,测序结果,还是非目的性条带。)
本人新虫,攒了两天,一共只能拿出7个金币,对不住大家了!!

跪求!克隆基因启动子,用HI-TAILPCR测序多次结果都是非目的条带,请教各位大神原因!
每3个一组,分别是2轮,3轮,和普通pcr3轮
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23柚子茶23

新虫 (小有名气)

4楼2016-04-19 15:53:44
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大brain

银虫 (小有名气)

如果选择条带,测序,选择第三轮产物比第二轮的小的去测序。确定三条特异引物没问题?takara的ex酶效率高些,好多tail-pcr文章都提到这个酶。稀释倍数建议50倍

发自小木虫Android客户端
态度很重要
2楼2015-10-30 13:09:32
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23柚子茶23

新虫 (小有名气)

3楼2016-04-19 15:53:24
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