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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 为什么计算不了有机小分子
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化育天工

金虫 (初入文坛)

[求助] 为什么计算不了有机小分子 已有1人参与

我想算甲醇的键长和键角，因此在MS数据库里直接导入了甲烷分子，然后将其中一个H改成了O，再进行了自动加H，点开结构优化计算发现RUN是暗的点不了。不知道是什么原因？有没有谁知道这是什么原因或者还有其他什么办法去计算甲醇的键长和键角。
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1楼 2015-10-20 14:57:51
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MR.L.413

新虫 (小有名气)
你这够捉急的，感觉一些基本操作你没看呀，有个改变原子种类的选项，你选中要改的然后再使用那个选项就好了

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6楼2015-10-22 17:16:44
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MR.L.413

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
化育天工: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-10-21 09:26:10
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-11-23 08:19:21
把它放在晶胞里面优化，计算都是有周期性的

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2楼2015-10-21 09:23:49
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化育天工

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by MR.L.413 at 2015-10-21 09:23:49
把它放在晶胞里面优化，计算都是有周期性的

谢谢你~另外我想问一下，我构建了一个金属氧化物晶胞，我想删除其中一个原子，但是只要点删除同类型的原子都删除了~我该怎么做才能只会删除一个~
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3楼2015-10-21 09:30:40
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MR.L.413

新虫 (小有名气)
先改成超胞，supercell，然后就可以随意删除任何一个了

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4楼2015-10-21 09:32:11
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