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高山流水循

木虫 (小有名气)

[求助] 基因序列中启动子和终止子的确定方法已有1人参与

各位同行们,
       你们好!
       请问怎么确定一个基因的启动子序列和终止子序列?
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独立卫生间

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香,分子生物期待您更多精彩。 2015-10-17 17:59:13
我最近也在为这个事情头痛,我需要确定一小段原核细胞中sRNA的转录起始和终止位点,由于该sRNA两端缺少保守的结构,给其边界定位带来了比较大的麻烦。宝生物有一款RACE试剂盒,只不过对于真核细胞来源的RNA效果更好。不过有幸的是我在NCBI上找到了14年美国一个课题组做的大肠杆菌K12 RNA-seq的数据,深入分析的话应该有助于确定特定序列附近的转录起始和终止位点!楼主可以尝试搜索所需数据,祝好运!
2楼2015-10-16 10:08:37
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高山流水循

木虫 (小有名气)

有帮助,真核生物的序列启动子序列,如酿酒酵母,还真不好确定,起始密码子上面哪一截是启动子序列,还真不好说,文献中有些给出了序列,但不知道他们是怎么确定的,……

发自小木虫Android客户端
3楼2015-10-17 00:16:36
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baichi121234

禁虫 (职业作家)

本帖内容被屏蔽

4楼2015-10-17 00:19:07
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咯咯哒9601

新虫 (初入文坛)

楼主你好,想问下你是否已经解决问题,我现在也需要寻找真菌中的终止子,老师让我去搜索文献,可是没有发现。是否可以通过生物信息学方法确定,还是需要实验方法?
5楼2019-03-28 14:20:35
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