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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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wgfz1979

铜虫 (正式写手)

[交流] 对称代码问题

大家好!
我有个问题:

(1)用wingx对CIF文件产生的platon.lst), 其中氢键中有这样的代码
          H24---O3   4564:  x, 3/2-y, -1/2+z

(2)而用XP产生的的代码却是:
      
         H24---O3   4575: x, 3/2-y, -1/2+z

(因为4555:  x, 1/2-y, -1/2+z, 所以4575应该是:x, 3/2-y, -1/2+z)

前面的那个号不一致:一个是4564,另一个是4575.这是怎么回事呢?

我们知道,如果要在CIF文件中写氢键信息时,那个号很有用的,写不对了就CHECK不过的.(附件在下面)

http://g.zhubajie.com/urllink.php?id=2899020cwyzd3wxv2gf7m37

[ Last edited by wgfz1979 on 2008-9-5 at 15:45 ]
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1楼 2008-09-05 15:06:46
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
有点奇怪. 一种解释是你的CIF中的坐标和.ins .res中的原子坐标不一致?
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xi2004-emuch@163.com
2楼2008-09-05 15:38:56
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sswgf1979

铜虫 (小有名气)
是吗？不理解．
都是同一个文件啊
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3楼2008-09-05 17:46:18
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★
wgfz1979(金币+1,VIP+0):XIEXIE!
老兄, 好象因为你的Fe 的y为 1.32, platon计算时可能帮你移动了. (我不熟悉platon)

看platon 给出的

Fe(1)       0.41359(4)     0.17749(4)     0.67522(5)   
Ti(1)       0.07974(5)     0.73148(5)     0.57151(6)

而你的
res, cif中

Fe1    5   0.413592   1.322509   0.175224  11.000000   0.045640 =
Ti1    4   0.079743   0.768519   0.071508  11.000000   0.041260 =   

所以, 要用xp中的.
你完全可以在.res中加氢键计算啊.
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xi2004-emuch@163.com
4楼2008-09-05 18:05:38
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wgfz1979

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2008-9-5 18:05:
老兄, 好象因为你的Fe 的y为 1.32, platon计算时可能帮你移动了. (我不熟悉platon)

看platon 给出的

Fe(1)       0.41359(4)     0.17749(4)     0.67522(5)   
Ti(1)       0.07974(5)     0.73148(5)  ...

怎么计算啊?请给出详细步骤!
谢谢!
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5楼2008-09-05 19:31:45
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
如果仅仅是O..O O...N 氢键,
你在.ins中加个HTAB就可以在 .lst中看到了.
如果要它出现在cif中, 则麻烦些.
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xi2004-emuch@163.com
6楼2008-09-05 20:13:54
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
看了一下你的cif, 好象已经有人帮你算好了嘛?
不过我不认为第一个
C12     H12     O3          0.9300     2.4800   2.802(5)     100.00   
是氢键, 角度太小了吧.
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xi2004-emuch@163.com
7楼2008-09-05 21:28:57
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
_diffrn_measured_fraction_theta_max    0.947

这个也是个问题.
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xi2004-emuch@163.com
8楼2008-09-05 21:31:49
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wgfz1979

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2008-9-5 21:28:
看了一下你的cif, 好象已经有人帮你算好了嘛?
不过我不认为第一个
C12     H12     O3          0.9300     2.4800   2.802(5)     100.00   
是氢键, 角度太小了吧.

哦,那个我知道, 我自己算的,只是我不明白我所发现的这个问题(如题所示)
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9楼2008-09-07 12:29:11
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wgfz1979

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2008-9-5 21:31:
_diffrn_measured_fraction_theta_max    0.947

这个也是个问题.

这个问题答非所问哦!
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10楼2008-09-07 12:30:30
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