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果果陶陶

木虫 (正式写手)

[求助] 如何建立不同晶型的双层结构模型

刚接触不是很懂。想建立石墨表面,在上面建立一层或多层某一晶面的Si。先把石墨build vaccum slab,然后如何在两层之间加入硅呢
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果果陶陶

木虫 (正式写手)

直接import Si然后取消对称性拷贝到两层之间可以了,但是无法进行结构优化和计算能量怎么回事,还有cleave出(110)面怎么加入啊
2楼2015-10-13 17:43:02
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冲天飞龙

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
果果陶陶: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-10-14 10:16:25
需要保证lattice能match上,可能需要先分别构建大晶胞(如MS的redefine lattice操作),适度缩放等操作,使得两者的lattice constant相等,再拷贝到一个同一个晶胞里面。

发自小木虫IOS客户端
3楼2015-10-13 18:21:41
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果果陶陶

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 冲天飞龙 at 2015-10-13 18:21:41
需要保证lattice能match上,可能需要先分别构建大晶胞(如MS的redefine lattice操作),适度缩放等操作,使得两者的lattice constant相等,再拷贝到一个同一个晶胞里面。
...

石墨和硅的晶体结构都不一样,这种情况怎么让lattice constant相等呢。cleave的面是不能直接取消周期性粘过去的吗
4楼2015-10-13 20:56:48
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冲天飞龙

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

所以需要做大晶胞,比如是单胞晶格常数的2倍3倍这样。两种材料都这么做,使得它们的大晶胞的lattice constant尽量接近。然后再拉伸或者压缩一下,使两者相等,就可以放在一起了

发自小木虫IOS客户端
5楼2015-10-13 22:48:14
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果果陶陶

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 冲天飞龙 at 2015-10-13 22:48:14
所以需要做大晶胞,比如是单胞晶格常数的2倍3倍这样。两种材料都这么做,使得它们的大晶胞的lattice constant尽量接近。然后再拉伸或者压缩一下,使两者相等,就可以放在一起了
...

能问下具体怎么操作吗,现在一个是六方的一个是面心立方,那是需要让他们部分匹配?
6楼2015-10-14 09:39:20
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冲天飞龙

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
果果陶陶: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-10-14 19:23:57
果果陶陶: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-10-15 11:12:01
切出来的要拼在一起的那个面要一致,为了方便可以把切出来的面先构建成长方形supercell

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7楼2015-10-14 16:31:06
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果果陶陶

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 冲天飞龙 at 2015-10-14 16:31:06
切出来的要拼在一起的那个面要一致,为了方便可以把切出来的面先构建成长方形supercell

还是不是很懂具体怎么操作 。
像我要把(001)作为衬底,build vacuum slab,截出Si(110)面build supercell,然后如何像你说的那样调整晶格常数啊,是调整那个lengths吗,最后选中所有元素在copy过去?geometry optimization后在计算energy?
这样一步步好麻烦你啊,有没有相关资料推荐呢
如何建立不同晶型的双层结构模型
graphite(001).png


如何建立不同晶型的双层结构模型-1
Si(110).png

8楼2015-10-15 11:10:25
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果果陶陶

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 冲天飞龙 at 2015-10-14 16:31:06
切出来的要拼在一起的那个面要一致,为了方便可以把切出来的面先构建成长方形supercell

9楼2015-10-15 16:31:59
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