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果果陶陶

木虫 (正式写手)

[求助] 如何建立不同晶型的双层结构模型

刚接触不是很懂。想建立石墨表面，在上面建立一层或多层某一晶面的Si。先把石墨build vaccum slab，然后如何在两层之间加入硅呢
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1楼 2015-10-13 15:37:19
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果果陶陶

木虫 (正式写手)
直接import Si然后取消对称性拷贝到两层之间可以了，但是无法进行结构优化和计算能量怎么回事，还有cleave出（110）面怎么加入啊
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2楼2015-10-13 17:43:02
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冲天飞龙

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
果果陶陶: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-10-14 10:16:25
需要保证lattice能match上，可能需要先分别构建大晶胞（如MS的redefine lattice操作），适度缩放等操作，使得两者的lattice constant相等，再拷贝到一个同一个晶胞里面。

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3楼2015-10-13 18:21:41
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果果陶陶

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 冲天飞龙 at 2015-10-13 18:21:41
需要保证lattice能match上，可能需要先分别构建大晶胞（如MS的redefine lattice操作），适度缩放等操作，使得两者的lattice constant相等，再拷贝到一个同一个晶胞里面。
...

石墨和硅的晶体结构都不一样，这种情况怎么让lattice constant相等呢。cleave的面是不能直接取消周期性粘过去的吗
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4楼2015-10-13 20:56:48
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冲天飞龙

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

所以需要做大晶胞，比如是单胞晶格常数的2倍3倍这样。两种材料都这么做，使得它们的大晶胞的lattice constant尽量接近。然后再拉伸或者压缩一下，使两者相等，就可以放在一起了

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5楼2015-10-13 22:48:14
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果果陶陶

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 冲天飞龙 at 2015-10-13 22:48:14
所以需要做大晶胞，比如是单胞晶格常数的2倍3倍这样。两种材料都这么做，使得它们的大晶胞的lattice constant尽量接近。然后再拉伸或者压缩一下，使两者相等，就可以放在一起了
...

能问下具体怎么操作吗，现在一个是六方的一个是面心立方，那是需要让他们部分匹配？
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6楼2015-10-14 09:39:20
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冲天飞龙

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
果果陶陶: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-10-14 19:23:57
果果陶陶: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-10-15 11:12:01
切出来的要拼在一起的那个面要一致，为了方便可以把切出来的面先构建成长方形supercell

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7楼2015-10-14 16:31:06
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果果陶陶

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 冲天飞龙 at 2015-10-14 16:31:06
切出来的要拼在一起的那个面要一致，为了方便可以把切出来的面先构建成长方形supercell

还是不是很懂具体怎么操作 。
像我要把（001）作为衬底，build vacuum slab，截出Si（110）面build supercell，然后如何像你说的那样调整晶格常数啊，是调整那个lengths吗，最后选中所有元素在copy过去？geometry optimization后在计算energy？
这样一步步好麻烦你啊，有没有相关资料推荐呢
如何建立不同晶型的双层结构模型
graphite（001）.png


如何建立不同晶型的双层结构模型-1
Si（110）.png
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8楼2015-10-15 11:10:25
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果果陶陶

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 冲天飞龙 at 2015-10-14 16:31:06
切出来的要拼在一起的那个面要一致，为了方便可以把切出来的面先构建成长方形supercell

9楼2015-10-15 16:31:59
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