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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » EMSA/ChIP » 怎样研究已知蛋白与哪些未知DNA结合
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douma2014

新虫 (初入文坛)

[交流] 怎样研究已知蛋白与哪些未知DNA结合

已知某蛋白是TetR家族的转录因子，具有能够与 DNA结合的HTH结构域，同时C端还含有LRR 富亮氨酸重复结构，我想找与该蛋白互作的未知DNA，不知道应从哪方面入手？是做CHIP吗？但我们没有相关的抗体，之前没有做过这方面的研究，所以清高人指导一下，如何进行这方面的实验，试验中应该注意哪些问题，采取什么方法，多谢啦
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1楼 2015-10-10 16:10:27
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douma2014

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaodahe at 2015-10-10 18:17:52
酵母单杂交，免疫共沉淀…

酵母单杂主要是研究与已知DNA结合的蛋白的吧，我是想研究一个与已知tetR家族转录调节抑制子相结合的DNA的互作，除了chip还有没有其他方法呀
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13楼2016-02-25 17:11:44
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zhaodahe

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
酵母单杂交，免疫共沉淀…

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2015-10-10 18:17:52
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douma2014

新虫 (初入文坛)
能具体说一下嘛，这方面确实太不了解了
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3楼2015-10-12 10:16:16
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douma2014

新虫 (初入文坛)
另外，免疫共沉淀也是需要相关抗体的呀，我没有这个蛋白的抗体，如果加标签的话是够能行
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4楼2015-10-12 10:17:42
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