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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » EMSA/ChIP » 怎样研究已知蛋白与哪些未知DNA结合
汕头大学海洋科学接受调剂
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douma2014

新虫 (初入文坛)

[交流] 怎样研究已知蛋白与哪些未知DNA结合

已知某蛋白是TetR家族的转录因子，具有能够与 DNA结合的HTH结构域，同时C端还含有LRR 富亮氨酸重复结构，我想找与该蛋白互作的未知DNA，不知道应从哪方面入手？是做CHIP吗？但我们没有相关的抗体，之前没有做过这方面的研究，所以清高人指导一下，如何进行这方面的实验，试验中应该注意哪些问题，采取什么方法，多谢啦
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1楼 2015-10-10 16:10:27
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zhaodahe

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
酵母单杂交，免疫共沉淀…

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2015-10-10 18:17:52
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douma2014

新虫 (初入文坛)
能具体说一下嘛，这方面确实太不了解了
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3楼2015-10-12 10:16:16
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douma2014

新虫 (初入文坛)
另外，免疫共沉淀也是需要相关抗体的呀，我没有这个蛋白的抗体，如果加标签的话是够能行
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4楼2015-10-12 10:17:42
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chs4502
5楼2015-10-13 08:50:30
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douma2014

新虫 (初入文坛)
有懂蛋白和DNA互作方面的吗，给点实验建议吧，实在是做这方面没底啊，盼回复
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6楼2015-10-14 15:49:57
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douma2014

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaodahe at 2015-10-10 18:17:52
酵母单杂交，免疫共沉淀…

能具体说下吗，这方面的实在是不懂
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7楼2015-11-06 11:13:32
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福建漳浦

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
其实，也可以预测启动子顺式作用元件，利用启动子钓蛋白进行验证，DNApulldown实验
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8楼2016-02-13 16:40:03
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xiangyingliu

银虫 (小有名气)
chip

发自小木虫Android客户端
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9楼2016-02-14 13:07:26
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xiangyingliu

银虫 (小有名气)
coIP

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10楼2016-02-14 13:07:50
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