24小时热门版块排行榜    

查看: 1036  |  回复: 5

peng1997

新虫 (小有名气)

[求助] 构建系统进化树的问题 已有1人参与

网上搜到的步骤
1.序列比对
2.掐头去尾 选取所需序列,转换格式
3.利用软件绘制系统进化树

不大理解第二步的选取所需序列,怎么选(软件中怎么实现),什么才是所需。
大神回复一下
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peng1997

新虫 (小有名气)

2楼2015-10-09 11:26:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

helios_hj

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
peng1997: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-10-09 15:09:25
第二步基本意思是手工修剪对齐所比对的序列,用bioedit可以做,MEGA也有个编辑功能
Ifyouthinkyoucan,youcan!!!
3楼2015-10-09 12:49:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peng1997

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by helios_hj at 2015-10-09 12:49:43
第二步基本意思是手工修剪对齐所比对的序列,用bioedit可以做,MEGA也有个编辑功能

如果跳过这步 直接建树 会有影响吗
这一步的必要性在哪
4楼2015-10-09 15:09:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

helios_hj

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by peng1997 at 2015-10-09 15:09:21
如果跳过这步 直接建树 会有影响吗
这一步的必要性在哪...

头尾一般测的不准,是必须去掉的,你用克隆测序的话可能还有残留质粒污染,比对一般选取测序准确的部分进行比对,而且长度尽量一致,所以要修剪对齐
Ifyouthinkyoucan,youcan!!!
5楼2015-10-09 15:16:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peng1997

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by helios_hj at 2015-10-09 15:16:02
头尾一般测的不准,是必须去掉的,你用克隆测序的话可能还有残留质粒污染,比对一般选取测序准确的部分进行比对,而且长度尽量一致,所以要修剪对齐...

请问在MEGA里怎么编辑
能不能截个图
6楼2015-10-09 16:02:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 peng1997 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学调剂 +6 yzysaa 2026-03-21 6/300 2026-03-25 09:27 by aa331100
[考研] 材料学求调剂 +6 Stella_Yao 2026-03-20 6/300 2026-03-25 00:37 by baoball
[考研] 0854 考研调剂 招生了!AI 方向 +5 pk3725069 2026-03-19 17/850 2026-03-24 17:30 by zhouxuan..
[考研] 321求调剂 +4 Ymlll 2026-03-24 4/200 2026-03-24 14:44 by sprinining
[考研] 环境学硕288求调剂 +8 皮皮皮123456 2026-03-22 8/400 2026-03-23 23:47 by 热情沙漠
[考研] 一志愿上海交大生物与医药专硕324分,求调剂 +5 jiajunX 2026-03-22 5/250 2026-03-23 18:07 by YMU施老师
[考研] 工科0856求调剂 +5 沐析汀汀 2026-03-21 5/250 2026-03-23 17:56 by 海瑟薇-
[考研] 一志愿070300浙大化学358分,求调剂! +4 酥酥鱼.. 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:12 by Iveryant
[考研] 317求调剂 +12 申子申申 2026-03-19 18/900 2026-03-22 22:23 by luoyongfeng
[考研] 寻找调剂 +4 倔强芒? 2026-03-21 4/200 2026-03-22 16:14 by 木托莫露露
[考研] 一志愿华中科技大学071000,求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 一志愿深大,0703化学,总分302,求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 296求调剂 +4 www_q 2026-03-20 4/200 2026-03-21 17:26 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿华南师大 070300(化学)304分求调剂 +3 0703武芊慧雪304 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:48 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:46 by JourneyLucky
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境专硕,总分308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:39 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大,求调剂 +5 材化逐梦人 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:26 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂 +9 何润采123 2026-03-18 11/550 2026-03-20 23:19 by JourneyLucky
[考研] 085410人工智能专硕317求调剂(0854都可以) +4 xbxudjdn 2026-03-18 4/200 2026-03-20 09:07 by 不168
信息提示
请填处理意见