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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 环境 » 环境生态 » 16SrDNA测序数据分析 需要发一篇文章一般要用到哪些结果进行分析，
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刘巧英123

铜虫 (初入文坛)

[求助] 16SrDNA测序数据分析 需要发一篇文章一般要用到哪些结果进行分析，已有3人参与

需要发一篇文章，一般要用到哪些结果进行分析？？？
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1楼2015-09-27 20:53:17
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rainmanzh

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
yanww_219: 金币+1, 积极交流 2015-09-28 15:57:21
不清楚你的研究方向，如果是细菌培养方面的研究，可以选一些结果进行对比分析，这方面的参考文献很多。
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2楼2015-09-28 14:46:42
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孤单的费米子

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
yanww_219: 金币+1, 积极交流 2015-09-28 15:57:13
具体问题具体分析。首先应对测序过程进行一个描述，确保得到的序列结果是可信和有效的；其次就是基本的分析啦，我做的是微生物生态，如α-多样性、β-多样性分析、聚类分析PCA、PCoA、分类建立系统发育树、热图等等，根据自己的需要拿出一些数据自己作图啊，总之分析自己要表达的内容！可以看看其他人的文章是怎么分析的，一句话：多看文献！
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3楼2015-09-28 15:17:07
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风铃永不孤单

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by 孤单的费米子 at 2015-09-28 15:17:07
具体问题具体分析。首先应对测序过程进行一个描述，确保得到的序列结果是可信和有效的；其次就是基本的分析啦，我做的是微生物生态，如α-多样性、β-多样性分析、聚类分析PCA、PCoA、分类建立系统发育树、热图等等 ...

α-多样性，β-多样性，各反映群落结构什么样的情况？与香浓指数有啥区别呀？？？我太明白，谢谢指教
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4楼2015-09-29 09:49:31
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HX91926

铜虫 (小有名气)
sci？比较难

发自小木虫Android客户端
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5楼2015-09-29 10:22:37
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孤单的费米子

新虫 (小有名气)
★
刘巧英123(vaughn代发): 金币+1, 积极帮助，指出数据分析重要性 2015-09-29 21:51:10
引用回帖:
4楼: Originally posted by 风铃永不孤单 at 2015-09-29 09:49:31
α-多样性，β-多样性，各反映群落结构什么样的情况？与香浓指数有啥区别呀？？？我太明白，谢谢指教...

α多样性就包括了香浓指数，还包括均匀度指数、辛普森、chao1指数，主要描述群落内的物种多样性，β多样性主要是生境间物种的变化情况，你多查查资料看看文献，数据分析基础太差发不了SCI
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6楼2015-09-29 11:10:16
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风铃永不孤单

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 孤单的费米子 at 2015-09-29 11:10:16
α多样性就包括了香浓指数，还包括均匀度指数、辛普森、chao1指数，主要描述群落内的物种多样性，β多样性主要是生境间物种的变化情况，你多查查资料看看文献，数据分析基础太差发不了SCI...

谢谢 指教
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7楼2015-09-30 09:48:07
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jackyoung

新虫 (正式写手)
看物种，看实验目的和研究体系，这个可是差异很大。

发自小木虫Android客户端
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CestLaVie
8楼2015-09-30 10:03:17
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