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刘巧英123

铜虫 (初入文坛)

[求助] 16SrDNA测序数据分析 需要发一篇文章一般要用到哪些结果进行分析, 已有3人参与

需要发一篇文章,一般要用到哪些结果进行分析???
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风铃永不孤单

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 孤单的费米子 at 2015-09-29 11:10:16
α多样性就包括了香浓指数,还包括均匀度指数、辛普森、chao1指数,主要描述群落内的物种多样性,β多样性主要是生境间物种的变化情况,你多查查资料看看文献,数据分析基础太差发不了SCI...

谢谢 指教
7楼2015-09-30 09:48:07
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查看全部 8 个回答

rainmanzh

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
yanww_219: 金币+1, 积极交流 2015-09-28 15:57:21
不清楚你的研究方向,如果是细菌培养方面的研究,可以选一些结果进行对比分析,这方面的参考文献很多。
2楼2015-09-28 14:46:42
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孤单的费米子

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
yanww_219: 金币+1, 积极交流 2015-09-28 15:57:13
具体问题具体分析。首先应对测序过程进行一个描述,确保得到的序列结果是可信和有效的;其次就是基本的分析啦,我做的是微生物生态,如α-多样性、β-多样性分析、聚类分析PCA、PCoA、分类建立系统发育树、热图等等,根据自己的需要拿出一些数据自己作图啊,总之分析自己要表达的内容!可以看看其他人的文章是怎么分析的,一句话:多看文献!
3楼2015-09-28 15:17:07
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风铃永不孤单

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by 孤单的费米子 at 2015-09-28 15:17:07
具体问题具体分析。首先应对测序过程进行一个描述,确保得到的序列结果是可信和有效的;其次就是基本的分析啦,我做的是微生物生态,如α-多样性、β-多样性分析、聚类分析PCA、PCoA、分类建立系统发育树、热图等等 ...

α-多样性,β-多样性,各反映群落结构什么样的情况?与香浓指数有啥区别呀???我太明白,谢谢指教
4楼2015-09-29 09:49:31
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