24小时热门版块排行榜    

查看: 259  |  回复: 2
当前主题已经存档。

hdd123

金虫 (正式写手)

[交流] 求助DGGE图谱分析都能得到哪些信息

如题,最近看文献发现,做总细菌或者真菌的就会用shannon指数和PCA或者聚类,而特异性微生物比如甲烷、解磷菌、解钾菌、硝酸还原菌之类的DGGE图谱分析一般是克隆和PCA或聚类,而没有shannon指数,为什么?这个指数在特异性微生物方面不能用嘛?
请求帮助!

[ Last edited by 350784478 on 2009-7-12 at 09:17 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xyklmu

至尊木虫 (知名作家)

虫眼看世界

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
DGGE图谱是检测突变或者SNP的存在与否的,一般会告诉你样品之间是否有SNP的存在以及有无突变的存在。
楼主所说的shannon指数是用别的软件做的吧?用于亲缘关系的鉴定或者聚类??
位卑未敢忘忧国。
2楼2008-09-02 08:46:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zjxjcj

银虫 (小有名气)

shanon指数不是用于多样性分析的么?一般看到的文献中shanon指数都是用于描述五种多样性的。也不是很清楚哈,大家继续讨论
3楼2008-09-02 22:26:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hdd123 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见