24小时热门版块排行榜    

查看: 2083  |  回复: 8

xzh410512206

银虫 (小有名气)

[求助] 关于Materials Studio(MS)和g09,固定角度优化有机分子,哪个精确?? 已有1人参与

如图8所示分子结构,我是用g09固定一边的角度,扫描了另一边,可是我家导师一直建议我用MS的Forcite模块算,
你们有谁用过MS分子力场扫描这种小分子的二面角吗??或者有见过用MS算有机小分子的文献吗??
恳请赐教。。

关于Materials Studio(MS)和g09,固定角度优化有机分子,哪个精确??


关于Materials Studio(MS)和g09,固定角度优化有机分子,哪个精确??-1
8.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xzh410512206

银虫 (小有名气)

这个三维图与此话题无关,误传的,大家无视吧
2楼2015-09-25 14:22:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
g09指高斯09?
高斯主要是量子力学力学吧,量子力学计算结果通常比较准确。
MS也有量子力学模块,在同样采用量子力学的前提下,MS和高斯计算结果准确度应该相当。
至于MS Forcite模块则是分子力学模块,准确度相对较低。
此外,MS中有专门的最优构象搜索功能,具体名称我忘记了,可以以非常小的角度间隔对二面角进行从0到180°的扫描。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
3楼2015-09-25 14:28:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xzh410512206

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-09-25 14:28:45
g09指高斯09?
高斯主要是量子力学力学吧,量子力学计算结果通常比较准确。
MS也有量子力学模块,在同样采用量子力学的前提下,MS和高斯计算结果准确度应该相当。
至于MS Forcite模块则是分子力学模块,准确度相 ...

您所说的  “MS中有专门的最优构象搜索功能,具体名称我忘记了,可以以非常小的角度间隔对二面角进行从0到180°的扫描。”
是哪个模块呢?至少确定不是Forcite,对吗?
4楼2015-09-25 14:36:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by xzh410512206 at 2015-09-25 14:36:33
您所说的  “MS中有专门的最优构象搜索功能,具体名称我忘记了,可以以非常小的角度间隔对二面角进行从0到180°的扫描。”
是哪个模块呢?至少确定不是Forcite,对吗?...

不是Forcite。不过该功能可能会调用Forcite作能量计算的引擎。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
5楼2015-09-25 14:39:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xzh410512206

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-09-25 14:39:30
不是Forcite。不过该功能可能会调用Forcite作能量计算的引擎。...

难怪。我按导师说的,用Forcite,fix打了对勾,快速优化完根本就没固定。。。
能麻烦您再具体说一下  是怎么操作的吗?不用急着回复,有事先忙
6楼2015-09-25 14:42:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xzh410512206: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-09-25 14:53:38
引用回帖:
6楼: Originally posted by xzh410512206 at 2015-09-25 14:42:39
难怪。我按导师说的,用Forcite,fix打了对勾,快速优化完根本就没固定。。。
能麻烦您再具体说一下  是怎么操作的吗?不用急着回复,有事先忙...

应该是模块Conformers。
我没有具体操作过,可参考相关教程。
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助!时间精力有限,恕不接受无偿私信求助。
7楼2015-09-25 14:48:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xzh410512206

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-09-25 14:48:10
应该是模块Conformers。
我没有具体操作过,可参考相关教程。...

那对于固定角度,扫描另一个角度,,是g09精确呢还是MS里这个Conformer精确呢??
8楼2015-09-25 14:54:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

引用回帖:
8楼: Originally posted by xzh410512206 at 2015-09-25 14:54:55
那对于固定角度,扫描另一个角度,,是g09精确呢还是MS里这个Conformer精确呢??...

g09
9楼2015-09-25 15:07:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xzh410512206 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 11/550 2026-08-23 02:55 by OEbVnUOu01ol
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 4/200 2026-08-23 01:04 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 00:40 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 3/150 2026-08-22 22:03 by OEbVnUOu01ol
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +3 简单化xn 2026-08-22 7/350 2026-08-22 19:46 by 简单化xn
[基金申请] 什么时候开奖? +7 CrisMessi 2026-08-18 8/400 2026-08-22 18:29 by 淀粉搬运工
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 让我中一个面上吧! +11 大萍1987 2026-08-20 13/650 2026-08-21 14:48 by 20120902066
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见