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BBMC-2012

木虫 (知名作家)


[求助] swiss-model 建模的时候我的序列匹配程度很低啊!已有2人参与

swiss-model 建模的时候我的序列匹配程度很低啊!我发现我的序列很长,模型序列很短,求高人怎么破?
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BBMC-2012

木虫 (知名作家)


引用回帖:
2楼: Originally posted by Fleaves at 2015-09-24 16:32:36
那没办法,能找到就不错了
一般来说,氨基酸序列相似度35%以上就可以认为其有相同的功能

我也发现,模型序列好几个,它们与我序列不同部位匹配
3楼2015-09-24 19:28:42
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查看全部 4 个回答

Fleaves

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
BBMC-2012: 金币+5, 有帮助 2015-09-24 19:28:58
那没办法,能找到就不错了
一般来说,氨基酸序列相似度35%以上就可以认为其有相同的功能
2楼2015-09-24 16:32:36
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小柠檬diudiu

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你可以选择你所需要的氨基酸片段重新建模,并不是所有序列都拿去建模都有意义的
4楼2017-03-08 15:08:16
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