应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps 两个group之间的静电和范德华能计算
81/1返回列表
查看: 2869  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

渭水飞熊

木虫 (小有名气)

[求助] lammps 两个group之间的静电和范德华能计算 已有1人参与

现在用lammps模拟一个体系，里面有两种分子A-B，现在想计算两种分子间的相互作用，A-A，A-B，B-B，要分别计算A-B之间的静电和范德华（ecoul、evdwl）大小，需要分开算出结果。
Lammps高手提供一些建议，谢谢！
ps.
使用compute group/group可以算A-B的相互作用能，但不能分开计算静电和范德华；使用compute pair 可以计算all，但好像不能计算自定义的group。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
盐是淡的，水是咸的
1楼 2015-09-24 12:09:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你设置好group，然后compute，用thermo控制输出不行吗？
thermo_style      custom etotal ke pe ebond eangle edihed eimp evdwl ecoul elong temp press
赞一下 回复此楼
2楼2015-09-24 14:13:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

渭水飞熊

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 赵红霞 at 2015-09-24 14:13:17
你设置好group，然后compute，用thermo控制输出不行吗？
thermo_style      custom etotal ke pe ebond eangle edihed eimp evdwl ecoul elong temp press

我冒昧的问一句，我在ps中说了是这样做，但是没有算出A-B之间的静电和范德华，只能计算出A-B之间pair的能量
我不知道是我没有表达清楚还是您没有看清楚
赞一下 回复此楼
盐是淡的，水是咸的
3楼2015-09-24 15:12:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

本帖仅楼主可见
赞一下
4楼2016-12-25 09:55:36
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

cszcyxzs

新虫 (正式写手)
楼主，你好，请问你找到怎么分别计算coul和vdw了吗?我现在也遇到了这个问题，不知道怎么解决。
赞一下 回复此楼
5楼2018-04-11 16:46:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

怜星追月

木虫 (小有名气)
你好楼主！这个问题你最终是怎么解决的，能分享一下方法吗？
赞一下 回复此楼
倚天照海花无数，流水山高心自如！
6楼2018-07-30 11:48:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaopopo_1

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 渭水飞熊 at 2015-09-24 15:12:23
我冒昧的问一句，我在ps中说了是这样做，但是没有算出A-B之间的静电和范德华，只能计算出A-B之间pair的能量
我不知道是我没有表达清楚还是您没有看清楚...

evdwl和 ecoul不是分别是范德华势能和库伦势能吗，您说的pair=evdwl+ecoul+elong吧
赞一下 回复此楼
7楼2019-04-12 15:35:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

乐奏球

新虫 (著名写手)
楼主请问你是怎么解决的能分享一下吗，我现在遇到和你同样的问题
赞一下 回复此楼
8楼2020-04-14 15:00:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 渭水飞熊 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +16 羊腰板 2026-08-21 17/850 2026-08-23 23:02 by tianxiaochun
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +12 大萍1987 2026-08-20 15/750 2026-08-23 20:44 by 大萍1987
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 什么时候开奖？ +9 CrisMessi 2026-08-18 10/500 2026-08-23 12:03 by 丶昵称占用
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭