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汕头大学海洋科学接受调剂
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渭水飞熊

木虫 (小有名气)

[求助] lammps 两个group之间的静电和范德华能计算 已有1人参与

现在用lammps模拟一个体系,里面有两种分子A-B,现在想计算两种分子间的相互作用,A-A,A-B,B-B,要分别计算A-B之间的静电和范德华(ecoul、evdwl)大小,需要分开算出结果。
Lammps高手提供一些建议,谢谢!
ps.
使用compute group/group可以算A-B的相互作用能,但不能分开计算静电和范德华;使用compute pair 可以计算all,但好像不能计算自定义的group。
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盐是淡的,水是咸的
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你设置好group,然后compute,用thermo控制输出不行吗?
thermo_style      custom etotal ke pe ebond eangle edihed eimp evdwl ecoul elong temp press
2楼2015-09-24 14:13:17
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渭水飞熊

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 赵红霞 at 2015-09-24 14:13:17
你设置好group,然后compute,用thermo控制输出不行吗?
thermo_style      custom etotal ke pe ebond eangle edihed eimp evdwl ecoul elong temp press

我冒昧的问一句,我在ps中说了是这样做,但是没有算出A-B之间的静电和范德华,只能计算出A-B之间pair的能量
我不知道是我没有表达清楚还是您没有看清楚
盐是淡的,水是咸的
3楼2015-09-24 15:12:23
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匿名

本帖仅楼主可见
4楼2016-12-25 09:55:36
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cszcyxzs

新虫 (正式写手)

楼主,你好,请问你找到怎么分别计算coul和vdw了吗?我现在也遇到了这个问题,不知道怎么解决。
5楼2018-04-11 16:46:46
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怜星追月

木虫 (小有名气)

你好楼主!这个问题你最终是怎么解决的,能分享一下方法吗?
倚天照海花无数,流水山高心自如!
6楼2018-07-30 11:48:44
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yaopopo_1

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 渭水飞熊 at 2015-09-24 15:12:23
我冒昧的问一句,我在ps中说了是这样做,但是没有算出A-B之间的静电和范德华,只能计算出A-B之间pair的能量
我不知道是我没有表达清楚还是您没有看清楚...

evdwl和 ecoul不是分别是范德华势能和库伦势能吗,您说的pair=evdwl+ecoul+elong吧
7楼2019-04-12 15:35:57
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乐奏球

新虫 (著名写手)

楼主请问你是怎么解决的能分享一下吗,我现在遇到和你同样的问题
8楼2020-04-14 15:00:09
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