24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1401  |  回复: 3

白玉浴血

木虫 (正式写手)

[求助] 请问有人使用density分析过数密度吗 已有1人参与

@    title "Partial densities"
@    xaxis  label "Box (nm)"
@    yaxis  label "Number density (nm\S-3\N)"
请问这里的y轴是什么意思
这里分析的是哪一时刻的结构呢?可不可以分析指定时间的结构的疏密度?
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

angjzy

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
白玉浴血: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-09-24 19:15:46
分析的是你输入的轨迹文件的平均值,要分析特定区间就加上 “-b” 开始时间 “-e” 结束时间
不知道如何用命令的时候就g_density -h
2楼2015-09-23 20:46:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

白玉浴血

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by angjzy at 2015-09-23 20:46:10
分析的是你输入的轨迹文件的平均值,要分析特定区间就加上 “-b” 开始时间 “-e” 结束时间
不知道如何用命令的时候就g_density -h

请问您有没有分析过回转半径,如果分析过麻烦给指点一下
Reading frame       0 time    0.000   Segmentation fault
这是我的问题
3楼2015-09-24 19:17:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

angjzy

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 白玉浴血 at 2015-09-24 19:17:24
请问您有没有分析过回转半径,如果分析过麻烦给指点一下
Reading frame       0 time    0.000   Segmentation fault
这是我的问题...

出现Segmentation fault就是你的轨迹文件xtc或者tpr有错误,你可以用gmxdump检查一下你的轨迹文件
4楼2015-09-24 23:52:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 白玉浴血 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 294分080500材料科学与工程求调剂 +10 柳溪边 2026-03-26 11/550 2026-03-31 18:14 by 544594351
[考研] 085601英二数二求调剂 总分325 +4 余航航 2026-03-31 4/200 2026-03-31 17:38 by 唐沐儿
[考研] 材料与化工(0856)304求B区调剂 +6 邱gl 2026-03-30 11/550 2026-03-31 16:34 by 邱gl
[考研] 334分 一志愿武理-080500 材料求调剂 +9 李李不服输 2026-03-25 9/450 2026-03-31 16:25 by hypershenger
[考研] 土木304求调剂 +3 顶级擦擦 2026-03-31 3/150 2026-03-31 13:59 by 西京学院招办
[考研] 材料调剂 5+5 想要一壶桃花水 2026-03-25 11/550 2026-03-31 13:34 by Huaxue_Wang
[考研] 一志愿北化085600材料专硕275|有文章专利|求调剂 +15 Micky11223 2026-03-25 16/800 2026-03-31 12:15 by oooqiao
[考研] 085600,专业课化工原理,320分求调剂 +6 大馋小子 2026-03-29 6/300 2026-03-31 10:03 by 氯化亚硝酰
[考研] 085600材料与化工调剂 +16 kikiki7 2026-03-30 16/800 2026-03-31 10:03 by 氯化亚硝酰
[考研] 0856调剂 +6 曲听筠 2026-03-30 6/300 2026-03-31 09:44 by Jaylen.
[考研] 08工科求调剂286 +5 tgs_001 2026-03-28 5/250 2026-03-31 08:18 by 一只好果子?
[考研] 085601一志愿西北工业大学初试346 +4 085601初试346 2026-03-30 4/200 2026-03-31 07:47 by jp9609
[有机交流] 甲基亚磺磺酸钠和甲基磺酸酯反应机理 10+3 kaobao456 2026-03-29 4/200 2026-03-30 23:16 by nBu锂
[考研] 332求调剂 +14 032500 2026-03-25 14/700 2026-03-30 20:03 by 无际的草原
[考研] 293求调剂 +3 末未mm 2026-03-30 5/250 2026-03-30 17:23 by 王保杰33
[考研] 275求调剂 +15 Micky11223 2026-03-25 20/1000 2026-03-29 20:44 by 唐沐儿
[考研] 一志愿211院校 344分 东北农业大学生物学学硕,求调剂 +5 丶风雪夜归人丶 2026-03-26 8/400 2026-03-27 19:22 by 丶风雪夜归人丶
[考研] 286求调剂 +4 lim0922 2026-03-26 4/200 2026-03-27 10:28 by guoweigw
[考研] 环境专硕324分求调剂推荐 +5 轩小宁—— 2026-03-26 5/250 2026-03-26 12:05 by i_cooler
[考研] 296求调剂 +4 汪!?! 2026-03-25 7/350 2026-03-25 16:41 by 汪!?!
信息提示
请填处理意见