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wgfz1979

铜虫 (正式写手)


[交流] 如何只用CIF文件就可以得到标准偏差数值

各位虫子:
大家好!
1.小弟在发文章时, 发现审稿人往往要你补上键长,键角的标准偏差数值,
(1)有些简单的键长,键角的标准偏差数值是可以在CIF或生成的Platon.lst中找到.但有些不是很好找,例如一个铜的配合物,(ccdc:146335, polyhedron,2001,20,579-584), 文章描述Cu和N1,N2,O1,O3所组成的平面距离是0.271(2) [Page 580, 2.4], 我用Mercury 测量一下得到0.271.这个(2),不知道他是怎么得到的.
如果有知道的请赐教!!谢谢.

[ Last edited by wgfz1979 on 2008-9-1 at 13:51 ]
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


wgfz1979(金币+1,VIP+0):XIEXIE!
我觉得象Platon, Diamond等程序, 它们可能可以根据你的晶胞参数的偏差来估算出一个键长,键角的偏差的. 但真正的偏差是非要有衍射点文件,通过结构精修后才能算的.
请高手指正.
xi2004-emuch@163.com
8楼2008-09-01 09:24:36
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
wgfz1979(金币+1,VIP+0):XIEXIE!
wgfz1979(金币+1,VIP+0):XIEXIE!
1. 要有.hkl, 经过精修后才有偏差.
2. 我认为不四舍五入也是可以的, 但象1.674(153)这样大的偏差, 比较键长已经没有意义.
xi2004-emuch@163.com
2楼2008-08-31 15:24:19
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redlin168

木虫 (正式写手)


wgfz1979(金币+1,VIP+0):XIEXIE!
好像将Cif文件导入到Platon中计算一下,就可以产生了,连氢键的误差都产生出来了

[ Last edited by redlin168 on 2008-8-31 at 19:09 ]
3楼2008-08-31 19:02:26
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wgfz1979

铜虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by redlin168 at 2008-8-31 19:02:
好像将Cif文件导入到Platon中计算一下,就可以产生了,连氢键的误差都产生出来了

[ Last edited by redlin168 on 2008-8-31 at 19:09 ]

是吗?我不会用PLANTON,也没有PLATON,你有吗?发个给我啊?顺便告诉我怎么安装的和导入的一步一步的方法.谢谢!
4楼2008-09-01 08:18:13
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