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HX91926

铜虫 (小有名气)

[求助] 测序结果怎么看对不对啊 已有7人参与

小弟导师做生物化学的,然后需要用几个真核蛋白,于是就转到大肠杆菌里,不表达。
导师说基因是人家处理过的,公司处理的可以在原核表达,公司怎么处理我就不知道了。
于是我就送去测了个序,公司说只有正向成功了,反向不成功,要单向测,我也不懂,就说好。
于是想先把送回来这个正向的看看。在线做的ncbi blast和开放阅读框不太明白。

不明白的是
1.这个开放阅读框最大的也才80个氨基酸,那应该是不太对把,比对结果是与mrna相似,应该是去掉内含子的,那怎么这样?
2,每个阅读框的起始为什么不是甲硫氨酸?起始是怎么算的?
3.blast比对结果具体怎么看,貌似相似度挺高的,有没有可能是一两个基因不对,就不表达?
会不会是测序问题,等单向测序出来了可能就不是这个结果了

测序结果怎么看对不对啊
搜狗截图20150921172104.png


测序结果怎么看对不对啊-1
搜狗截图20150921172121.png


测序结果怎么看对不对啊-2
搜狗截图20150921185622.png
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ypslly

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
HX91926: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-09-28 17:03:19
引用回帖:
27楼: Originally posted by HX91926 at 2015-09-22 21:45:28
是啊,因为我们实验室自己做不了重组质粒,所以什么都没有,引物也没有,我就问公司可不可以测,他问我什么质粒,我告诉他是pet30,他说可以测,然后测的就是这个。我是想看看别人给我们做的重组质粒对不对
...

从网上可以找到pet30的全序列和详细信息,包括多克隆位点,启动子,起始翻译翻译位置之类的都有。自己能查清楚的。

发自小木虫Android客户端
30楼2015-09-23 11:21:19
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查看全部 32 个回答

xy531483760

金虫 (小有名气)

有,原理我不清楚,我只会做

发自小木虫Android客户端
比较笨的小虫虫
3楼2015-09-22 00:11:16
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xy531483760

金虫 (小有名气)

orf。。。我们老师让我做的就是找序列,八十多个的很正常

发自小木虫Android客户端
比较笨的小虫虫
4楼2015-09-22 00:13:46
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xy531483760

金虫 (小有名气)

不是M的原因会不会是蛋白质不完整?我并不是特别懂,但是我实验做的步骤应该和你差不多

发自小木虫Android客户端
比较笨的小虫虫
5楼2015-09-22 00:15:35
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