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关于BLAST在引物设计方面的应用!
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大家好!小弟,最近在进行引物设计,下面是个人的一些想法,也许不对,希望高人给予指点! 引物设计的步骤: 1.首先登陆GENEBANK-找到我需要的目标基因,一共有3条记录,每条记录都是我所需要的病原菌的不同区域的基因序列 2.究竟以哪一条记录的基因序列来作为我设计引物的模板呢? 于是我把每个序列都输入进primer-blast,分别检索出它帮我设计的各10对引物,每对引物都显示了潜在的非特异性模板,我筛选出含最少的同一属的潜在模板的引物,以此作为最后我所需要的引物 3.另外一种方法是:我将搜索出的三条记录分别通过primer 5.0设计引物,找出每个评分最高的引物,再分别输入BLAST,看此引物的特异性如何 高手们,帮忙看看我的这个引物设计的过程可以吗?BLAST是这样用的吗?谢谢指点! |
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