应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】在使用G3MP2方法计算能量时出错
51/1返回列表
查看: 421  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

majun04

木虫 (著名写手)

majun

[交流] 【求助】在使用G3MP2方法计算能量时出错

在用G3MP2计算能量的时候，在计算的第五步出现错误，提示如下：
Standard basis: GTMP2large (5D, 7F)
Atomic number out of range in G3lBas.
Error termination via Lnk1e in /home/majun/gaussian03/g03/l301.exe at Sat Aug 30 18:03:40 2008.
请问是什么原因？我计算的是一个络合物分子，中心原子是锌原子。
G3MP2方法是否是对所有的原子都适合，还是有一定的限制？请高手帮忙解答。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
乐观、执着、勤奋
1楼 2008-08-30 21:50:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wxjbuilder

木虫 (知名作家)
换个小基组试一下或是换力场RADII=UFF试一下
赞一下 回复此楼
悠悠天地，奈何独立苍茫？
2楼2008-08-31 09:24:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

虚谦

至尊木虫 (正式写手)
基组错误啊，你贴出来啊！
赞一下 回复此楼
大家都说我是个好人，其实，我也是这么想的~！
3楼2008-08-31 09:33:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

majun04

木虫 (著名写手)

majun
引用回帖:
Originally posted by 虚谦 at 2008-8-31 09:33:
基组错误啊，你贴出来啊！

错误提示如下：
Link1:  Proceeding to internal job step number  5.
-----------------------------------------------------
#N Geom=AllCheck Guess=Read SCRF=Check MP2/GTMP2Large
-----------------------------------------------------
1/29=7,38=1,40=1,46=1/1;
2/40=1/2;
3/5=25,11=9,16=1,25=1,30=1,70=2/1,2,3;
4/5=1/1;
5/5=2,38=6/2;
8/10=1,27=-          /1;
9/16=-3,27=-          /6;
6/7=2,8=2,9=2,10=2/1;
99/5=1,9=1/99;
----------------------------
ZnAc2 gas phase readisotopes
----------------------------
Redundant internal coordinates taken from checkpoint file:
ZnAc2_CCCBDB_G3MP2.chk
Charge =  0 Multiplicity = 1
Zn,0,-0.0117054138,0.0017726006,0.0074728836
O,0,0.0016386899,-0.1711273901,1.9953503813
O,0,1.820732786,0.1714827918,0.7834117389
O,0,-1.0729394854,1.0903975686,-1.2843421101
O,0,-0.7857260043,-1.0954112473,-1.4715258266
C,0,1.270816086,0.0020563273,1.929247021
C,0,-1.2897202111,-0.0040832106,-1.9172937068
C,0,-2.0877690443,0.0036817598,-3.1824784783
H,0,-2.8709532128,0.7592205052,-3.1234008653
H,0,-1.4231799926,0.2645750509,-4.0106407743
H,0,-2.5098074289,-0.9829363998,-3.368445688
C,0,2.1026401125,-0.0353244638,3.1719456494
H,0,2.3657244042,-1.07562397,3.3822766835
H,0,3.0199255525,0.534131798,3.0280431229
H,0,1.5307441653,0.3505452508,4.0153789816
Recover connectivity data from disk.
                          Input orientation:                          
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic     Atomic              Coordinates (Angstroms)
Number     Number      Type              X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
    1         30             0       -0.011705    0.001773    0.007473
    2          8             0        0.001639   -0.171127    1.995350
    3          8             0        1.820733    0.171483    0.783412
    4          8             0       -1.072939    1.090398   -1.284342
    5          8             0       -0.785726   -1.095411   -1.471526
    6          6             0        1.270816    0.002056    1.929247
    7          6             0       -1.289720   -0.004083   -1.917294
    8          6             0       -2.087769    0.003682   -3.182478
    9          1             0       -2.870953    0.759221   -3.123401
   10          1             0       -1.423180    0.264575   -4.010641
   11          1             0       -2.509807   -0.982936   -3.368446
   12          6             0        2.102640   -0.035324    3.171946
   13          1             0        2.365724   -1.075624    3.382277
   14          1             0        3.019926    0.534132    3.028043
   15          1             0        1.530744    0.350545    4.015379
---------------------------------------------------------------------
                    Distance matrix (angstroms):
                    1          2          3          4          5
     1  Zn   0.000000
     2  O    1.995427   0.000000
     3  O    1.997176   2.212528   0.000000
     4  O    1.995021   3.674581   3.673329   0.000000
     5  O    1.997588   3.673346   3.671974   2.212530   0.000000
     6  C    2.310428   1.282643   1.282206   4.123692   4.122991
     7  C    2.310429   4.123626   4.123051   1.282774   1.282075
     8  C    3.806026   5.586242   5.570712   2.411172   2.414680
     9  H    4.307133   5.942974   6.133558   2.593197   3.242919
    10  H    4.266915   6.188043   5.789177   2.870079   2.950087
    11  H    4.313582   5.978018   6.109352   3.272123   2.565816
    12  C    3.806011   2.411851   2.413987   5.586596   5.570303
    13  H    4.266410   2.886274   2.933665   6.188165   5.787178
    14  H    4.312544   3.267094   2.570593   5.971402   6.114288
    15  H    4.308608   2.586662   3.249888   5.950932   6.128862
                    6          7          8          9         10
     6  C    0.000000
     7  C    4.620851   0.000000
     8  C    6.116358   1.495873   0.000000
     9  H    6.576990   2.130170   1.089819   0.000000
    10  H    6.527541   2.114732   1.093433   1.768592   0.000000
    11  H    6.582467   2.133684   1.089089   1.795991   1.774671
    12  C    1.495870   6.116326   7.611817   8.062216   8.006928
    13  H    2.114596   6.526555   8.005905   8.550631   8.414699
    14  H    2.133036   6.581723   8.058567   8.520175   8.328080
    15  H    2.130951   6.578555   8.063690   8.396674   8.552780
                   11         12         13         14         15
    11  H    0.000000
    12  C    8.059117   0.000000
    13  H    8.327764   1.093470   0.000000
    14  H    8.590373   1.089220   1.773351   0.000000
    15  H    8.522036   1.089651   1.769737   1.796162   0.000000
Stoichiometry    C4H6O4Zn
Framework group  C1[X(C4H6O4Zn)]
Deg. of freedom    39
Full point group                 C1
Largest Abelian subgroup         C1      NOp   1
Largest concise Abelian subgroup C1      NOp   1
                         Standard orientation:                        
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic     Atomic              Coordinates (Angstroms)
Number     Number      Type              X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
    1         30             0       -0.000001    0.008726   -0.000219
    2          8             0       -1.666752    0.734327   -0.823125
    3          8             0       -1.656684   -0.723298    0.841359
    4          8             0        1.667169    0.835645    0.718707
    5          8             0        1.656251   -0.829003   -0.738728
    6          6             0       -2.310383    0.006447    0.014194
    7          6             0        2.310371    0.003281   -0.015440
    8          6             0        3.805913   -0.019693    0.006019
    9          1             0        4.191304    0.990236    0.144673
   10          1             0        4.131712   -0.629013    0.853474
   11          1             0        4.189707   -0.461760   -0.912346
   12          6             0       -3.805897   -0.020706   -0.003973
   13          1             0       -4.130588   -0.766439   -0.734817
   14          1             0       -4.189074   -0.302746    0.975838
   15          1             0       -4.192917    0.950607   -0.310742
---------------------------------------------------------------------
Rotational constants (GHZ):      5.9671784      0.6323621      0.6323499
Standard basis: GTMP2large (5D, 7F)
Atomic number out of range in G3lBas.
Error termination via Lnk1e in /home/majun/gaussian03/g03/l301.exe at Sat Aug 30 18:03:40 2008.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  4.2 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   5446 Int=      0 D2E=      0 Chk=      9 Scr=      1
赞一下 回复此楼
乐观、执着、勤奋
4楼2008-08-31 14:56:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

majun04

木虫 (著名写手)

majun
请高手帮忙啊。
对于组合算法，能不能对其中的某个计算步骤进行机组设置，应用到分子中的某个原子？
赞一下 回复此楼
乐观、执着、勤奋
5楼2008-09-01 08:22:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 majun04 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭