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11月的葫芦木虫 (著名写手)
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[求助]
关于测序结果比对的问题 已有3人参与
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我之前做实验提取了一段核酸PCR后，把PCR结果送到公司测序，测序完成的结果用NCBI上的blast进行了序列比对，结果如下面的图表示。 我的问题是怎么看哪条序列与我提供的同源性比较高，怎么看，可不可以判断分型？ 由于第一张图看不清楚，上传了后面2张，第二张图是第一张的左侧结果，第三张图是第一张的右侧结果  序列比对.jpg  序列比对.jpg  序列比对.jpg |
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2楼2015-09-18 17:53:58
helios_hj
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 18 (小学生)
- 金币: 23149.9
- 散金: 10
- 红花: 1
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- 在线: 53.4小时
- 虫号: 3926074
- 注册: 2015-06-15
- 性别: GG
- 专业: 病原细菌、细菌感染与宿主
3楼2015-09-18 20:55:37
renzhiq
木虫 (小有名气)
- 应助: 56 (初中生)
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- 红花: 9
- 帖子: 298
- 在线: 53.3小时
- 虫号: 1949303
- 注册: 2012-08-21
- 性别: GG
- 专业: 微生物学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
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首先，你肯定是新手。 再者，测序公司反回来的结果不可以直接用来blast，因为前后两段都测不准，要参照测序的原始图谱选择测序可靠的部分来blast 如果还有疑问可以联系我，想要确定分型，还要结合其他的数据，不能简单的有这个数据就定分型，不然有可能会吃大亏的…… 发自小木虫Android客户端 |
4楼2015-09-19 00:02:23
120