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| Amino acid sequences were given as input in phylip format keeping LG (Le and Gascuel) substitution model and proportion of invariable sites and number of substitution rate categories as 0 and 4. |
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至尊木虫 (知名作家)
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【答案】应助回帖
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爱与雨下: 金币+1 2015-09-18 06:41:16
叫我扬子鳄: 金币+5, 翻译EPI+1, 1 2015-09-18 09:25:37
爱与雨下: 金币+1 2015-09-18 06:41:16
叫我扬子鳄: 金币+5, 翻译EPI+1, 1 2015-09-18 09:25:37
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这是使用 PhyML 构建进化树的设计参数： 输入文件（Input File Format）：phylip格式，即以氨基酸序列的phylip格式作为输入； 氨基酸的模型（substitution model）：LG （对氨基酸模型这是默认的）； 不变位点的比例（proportion of invariable sites）：0 （通常为[0,1]区间的数） 替代率类别数（ Number of substitution rate categories）：4 |
2楼2015-09-18 00:45:54