24小时热门版块排行榜    

查看: 1639  |  回复: 3

1989shaonan

金虫 (小有名气)

[交流] DFT计算中的氢键和质子迁移问题

采用Gaussian中的DFT/B3LYP计算水合金属离子或其它一些氢键/质子的结构时,经常会出现奇怪的质子迁移,比如:
(1) 金属-水杨酸配合物,本来想计算酚羟基质子解离的过渡态,结果优化得到的路径却是质子转移到苯环上(图1. png),反应的活化能~200 kJ mol-1, 产物比反应物能量低~50 kJ mol-1。这条反应路径蛮奇怪的,不知道是不是真的可以在比如高温条件下发生,或者是DFT的方法问题;

(2) 另外一种就是水合金属离子M(H2O)6,尤其是对于一些电荷高、半径小的金属离子,在DFT计算中,配位水上的质子很容易转移到其它分子或阴离子上,形成M(H2O)5(OH) (图2. png,图3.png)。文献中把这种情况归结为DFT方法处理氢键的缺陷,但如何判断这种质子迁移会不会是真实存在的呢?

DFT计算中的氢键和质子迁移问题
1.png


DFT计算中的氢键和质子迁移问题-1
2.png


DFT计算中的氢键和质子迁移问题-2
3.png
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1989shaonan: 金币+1 2015-09-17 23:37:15
采用Gaussian中的DFT/B3LYP计算水合金属离子或其它一些氢键/质子的结构时,出现奇怪的结果,是DFT方法处理氢键的缺陷,因为B3LYP没有考虑关键的电子相关。
2楼2015-09-17 14:10:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1989shaonan

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2015-09-17 14:10:09
采用Gaussian中的DFT/B3LYP计算水合金属离子或其它一些氢键/质子的结构时,出现奇怪的结果,是DFT方法处理氢键的缺陷,因为B3LYP没有考虑关键的电子相关。

谢谢回复。那么若采用HF或MP2方法计算得到类似的质子迁移结果,是否可以认为该反应路径是没有问题的呢?
3楼2015-09-17 14:58:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1989shaonan: 金币+1 2015-09-17 23:37:20
HF同样不行,也没有考虑电子相关。MP2可以考虑。
4楼2015-09-17 16:29:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shaonan 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 wsYGJnURYvm6 2026-08-31 3/150 2026-09-01 01:40 by o3EMxHUAQDtS
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +6 叶九微 2026-08-26 6/300 2026-08-31 23:54 by yudaoqian88
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 EZ67DG6CvcKL 2026-08-31 3/150 2026-08-31 22:23 by o3EMxHUAQDtS
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-31 21:30 by xiangy672
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
请填处理意见