24小时热门版块排行榜    

查看: 1660  |  回复: 3

1989shaonan

金虫 (小有名气)

[交流] DFT计算中的氢键和质子迁移问题

采用Gaussian中的DFT/B3LYP计算水合金属离子或其它一些氢键/质子的结构时,经常会出现奇怪的质子迁移,比如:
(1) 金属-水杨酸配合物,本来想计算酚羟基质子解离的过渡态,结果优化得到的路径却是质子转移到苯环上(图1. png),反应的活化能~200 kJ mol-1, 产物比反应物能量低~50 kJ mol-1。这条反应路径蛮奇怪的,不知道是不是真的可以在比如高温条件下发生,或者是DFT的方法问题;

(2) 另外一种就是水合金属离子M(H2O)6,尤其是对于一些电荷高、半径小的金属离子,在DFT计算中,配位水上的质子很容易转移到其它分子或阴离子上,形成M(H2O)5(OH) (图2. png,图3.png)。文献中把这种情况归结为DFT方法处理氢键的缺陷,但如何判断这种质子迁移会不会是真实存在的呢?

DFT计算中的氢键和质子迁移问题
1.png


DFT计算中的氢键和质子迁移问题-1
2.png


DFT计算中的氢键和质子迁移问题-2
3.png
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1989shaonan: 金币+1 2015-09-17 23:37:15
采用Gaussian中的DFT/B3LYP计算水合金属离子或其它一些氢键/质子的结构时,出现奇怪的结果,是DFT方法处理氢键的缺陷,因为B3LYP没有考虑关键的电子相关。
2楼2015-09-17 14:10:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

1989shaonan

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhou2009 at 2015-09-17 14:10:09
采用Gaussian中的DFT/B3LYP计算水合金属离子或其它一些氢键/质子的结构时,出现奇怪的结果,是DFT方法处理氢键的缺陷,因为B3LYP没有考虑关键的电子相关。

谢谢回复。那么若采用HF或MP2方法计算得到类似的质子迁移结果,是否可以认为该反应路径是没有问题的呢?
3楼2015-09-17 14:58:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1989shaonan: 金币+1 2015-09-17 23:37:20
HF同样不行,也没有考虑电子相关。MP2可以考虑。
4楼2015-09-17 16:29:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shaonan 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +6 两三岁ss 2026-09-14 6/300 2026-09-15 20:17 by 只吃肉葡萄
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 23jxep3nCNZb 2026-09-14 3/150 2026-09-15 18:47 by CgyNCDVNhGVg
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 17:39 by CgyNCDVNhGVg
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-15 16:59 by CgyNCDVNhGVg
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 7/350 2026-09-15 16:47 by CgyNCDVNhGVg
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-15 16:35 by CgyNCDVNhGVg
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-15 16:15 by CgyNCDVNhGVg
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 5/250 2026-09-15 15:14 by CgyNCDVNhGVg
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-15 14:58 by CgyNCDVNhGVg
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-15 14:50 by VMDqgnlKimtZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-15 14:34 by VMDqgnlKimtZ
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +6 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-15 14:13 by VMDqgnlKimtZ
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-15 14:02 by VMDqgnlKimtZ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-15 08:02 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:38 by 5BDX0d0WFp7t
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-15 05:22 by 5BDX0d0WFp7t
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-14 21:25 by vZfe6xYu34yj
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:13 by Aj1rhIDL5ixY
[找工作] 浙江师范大学是怎么坑我的 +6 recruit123 2026-09-09 6/300 2026-09-14 12:00 by 萨仁其其格
[教师之家] 浙江师范大学是怎么坑我的 +10 recruit123 2026-09-09 15/750 2026-09-13 10:45 by seaskyy
信息提示
请填处理意见