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244073931

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 结晶水上加不上氢,如何处理?

配合物晶体中经常有水存在,但是最近我借了一个结构就是加不上氢,用了好多个q,O周围就是没有q,最后即使加上了精修后又跑掉了,虽然我用了DFIX命令限制OH距离。请问高手如何处理。
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


纳米镍粉(金币+1,VIP+0):
我个人看法, 加不了就不加. 实际上勉强加往往是错的.
但在CIF中可能要加个说明.

不知gujm等高手怎么看?
xi2004-emuch@163.com
2楼2008-08-29 11:06:03
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244073931

至尊木虫 (著名写手)

谢谢!有时候加不了氢,氢键问题没法讨论。
3楼2008-08-29 11:08:49
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)


纳米镍粉(金币+1,VIP+0):
如果勉强要加的话, 峰搞到200,加HTAB, 看看那个氢更合理, 更适合氢键. DFIX可能还不够, 还要DANG.
但是如果结构数据不够好, 加氢就是一个字, 蒙
xi2004-emuch@163.com
4楼2008-08-29 11:33:59
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

偶有时候根据氢键人为加氢  不知道行不行
5楼2008-08-29 12:11:12
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zwh030404

木虫 (著名写手)


纳米镍粉(金币+1,VIP+0):
你可以试试用dfix o h距离,dfixl两个氢之间的距离(固定角度),一般都会加好的!
6楼2008-08-29 18:51:07
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lizuoxi

金虫 (正式写手)

这年头除了水带,
配位化学领域讨论氢键还有啥意义
7楼2008-08-29 23:24:08
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sunjunshan79

木虫 (正式写手)

呵呵,我可以帮助你加
8楼2008-08-31 09:13:48
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