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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 类似转录组分析的方法
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shadowshade

新虫 (初入文坛)

[求助] 类似转录组分析的方法 已有1人参与

请高人指点：我想寻找在不同培养基的条件下，实验室的真菌都有哪些酶和蛋白相关基因的表达量有变化；原本打算使用转录组分析，但和实验室的师兄师姐们谈过之后觉得成本太高，而且数据结果太多，有没有什么别的简单便宜一些的方法寻找同一真菌在不同条件下都有哪些基因表达的量不同？
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1楼 2015-09-13 21:21:30
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刘丽娜12

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shadowshade: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-09-14 09:40:06
比如基因表达谱~其实现在做转录组也不贵啦。我大真菌数据量比植物动物都要小~~

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2楼2015-09-13 21:47:59
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shadowshade

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 刘丽娜12 at 2015-09-13 21:47:59
比如基因表达谱~其实现在做转录组也不贵啦。我大真菌数据量比植物动物都要小~~

听说现在一个真菌的样要3000块，加上对照怎么的也得3个样，出来的90bp的数据动不动就好十几万条，拼接之后成百上千，真的分不清哪个才是要找的目的基因。。。。
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3楼2015-09-14 09:39:44
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刘丽娜12

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by shadowshade at 2015-09-14 09:39:44
听说现在一个真菌的样要3000块，加上对照怎么的也得3个样，出来的90bp的数据动不动就好十几万条，拼接之后成百上千，真的分不清哪个才是要找的目的基因。。。。...

有相关的信号通路。其实有些事看起来难度大，做起来也还好。

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4楼2015-09-14 09:47:39
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shadowshade

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 刘丽娜12 at 2015-09-14 09:47:39
有相关的信号通路。其实有些事看起来难度大，做起来也还好。
...

请问基因表达谱的价格如何，是否需要试剂盒对RNA进行特殊处理？
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5楼2015-09-14 19:54:26
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刘丽娜12

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by shadowshade at 2015-09-14 19:54:26
请问基因表达谱的价格如何，是否需要试剂盒对RNA进行特殊处理？...

这个不好意思我没做过~反正比转录组便宜。想做可以咨询公司嘛

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6楼2015-09-14 20:59:22
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