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tiani_tan

金虫 (小有名气)

[求助] SSR多态性 片段大小范围已有1人参与

请教一个问题:SSR引物筛选多态性,跑胶时对于PCR产物大小有没有限制?导师只要多态性在100-300bp范围内?这个是什么依据?
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蜈蚣出门

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
tiani_tan: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 非常感谢,懂了!! 2015-09-13 22:08:49
SSR重复序列motif一般以2-6个碱基为主,重复次数6-14,也就是ssr长度为12-30bp左右,再加上左右引物 (大概各20几个碱基),这样就有60bp以上,考虑设计引物要与ssr间隔15bp以上,加起来差不多100  bp,至于上限300bp,设计引物之后发现总长度就在这范围之内,太长了扩增出来杂带更多

发自小木虫Android客户端
2楼2015-09-13 09:27:44
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3楼2015-09-13 13:40:15
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nimaquzhen

木虫 (小有名气)

送红花一朵
优秀
4楼2020-11-27 19:50:06
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