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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » autodocking无法载入蛋白pdbqt文件
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tingting1204

金虫 (正式写手)

[求助] autodocking无法载入蛋白pdbqt文件 已有3人参与

蛋白、配体都准备好，并且成功运行了autogrid，生成了一系列文件，但是在进行autodock，Docking>Macromolecule>Set Rigid Filename…>，这时选择蛋白pdbqt分子，但是PMV窗口中看不到蛋白分子，这是啥原因呢？请求各位高手的帮助！谢谢啦！
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1楼 2015-09-10 15:33:14
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a86052

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
好像就是那样，直接把其他参数输进去，运行试一下不就行了~
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2楼2015-09-11 09:17:10
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tingting1204

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by a86052 at 2015-09-11 09:17:10
好像就是那样，直接把其他参数输进去，运行试一下不就行了~

我试了，无法载入蛋白，所以计算的结果就有问题了，不知怎么办？
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3楼2015-09-13 14:43:33
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tingting1204

金虫 (正式写手)
一直未解决呢！请求帮助
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4楼2015-09-14 10:11:18
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

后台调用了这个蛋白，继续往下做就可以
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5楼2015-09-14 14:01:28
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341176

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

点击command prompt右键，属性里面把start in 和 target那里面的参数改成vina的途径，否则的话系统找不到你的文件
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6楼2015-09-23 10:32:12
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匿名

用户注销 (初入文坛)
本帖仅楼主可见
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7楼2018-11-05 10:32:53
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盛夏Noble

银虫 (初入文坛)
你好，问题解决了吗？怎么解决的，我的也是这样
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8楼2019-09-12 15:46:43
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874643370

木虫 (正式写手)
解决了吗？同问
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努力就会有希望
9楼2020-03-13 00:30:06
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bio-boy

铁杆木虫 (著名写手)
请问问题是如何解决的，谢谢！
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10楼2020-07-04 22:22:54
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