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qjc830401

荣誉版主 (著名写手)

Chem.Q

[交流] 求助单晶弱氢键的处理方法

求助单晶弱氢键的处理方法, 希望XDJM多多帮助,谢谢!

[ Last edited by qjc830401 on 2008-8-27 at 14:25 ]
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http://www.pet2008.cn/index.php?fromuid=11277
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hqzhang80

木虫 (小有名气)

啥样的弱氢键?C-H-O,C-H-N,C- H-Cl?
2楼2008-08-27 10:49:33
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qjc830401

荣誉版主 (著名写手)

Chem.Q

引用回帖:
Originally posted by hqzhang80 at 2008-8-27 10:49:
啥样的弱氢键?C-H-O,C-H-N,C- H-Cl?

N-H-N N-H-O C-H-N 的  

用pwt处理处理的H键 有A类错误
http://www.pet2008.cn/index.php?fromuid=11277
3楼2008-08-27 11:21:49
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

应该lst文件里会给出一些氢键的吧 太弱的氢键是不是可以不考虑
4楼2008-08-27 12:34:45
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gujm516

金虫 (小有名气)

是不是对称代码的原因。
这样问有点不着边际,把A类问题也一同贴出来,大家一起分析。
5楼2008-08-27 12:38:13
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crystalsnet

新虫 (正式写手)

应该是对称代码的问题,我发现很多时候platon算出的氢键代码有问题
6楼2008-08-27 13:02:01
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qjc830401

荣誉版主 (著名写手)

Chem.Q

谢谢各位XDJM   A类错误是这样的
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   16.405(5), Rep    2.889(4), Dev..    2703.20 Sigma
              N1   -O       1.555   4.455                                      
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   17.486(5), Rep    3.029(4), Dev..    2891.40 Sigma
              N1   -N2      1.555   4.455                                      
PLAT707_ALERT_1_A D...A   Calc   16.616(6), Rep    3.061(4), Dev..    2259.17 Sigma
              C1   -N2      1.555   4.455                                      
PLAT726_ALERT_1_A H...A   Calc    17.20000, Rep     2.05000 Dev...      15.15 Ang.
              H1A  -O       1.555   4.455                                      
PLAT726_ALERT_1_A H...A   Calc    18.27000, Rep     2.52000 Dev...      15.75 Ang.
              H1A  -N2      1.555   4.455                                      
PLAT726_ALERT_1_A H...A   Calc    16.81000, Rep     2.56000 Dev...      14.25 Ang.
              H1B  -N2      1.555   4.455                                      
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc       22.00, Rep      164.00 Dev...     142.00 Deg.
              N1   -H1A  -O       1.555   1.555   4.455                        
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc       24.00, Rep      119.00 Dev...      95.00 Deg.
              N1   -H1A  -N2      1.555   1.555   4.455                        
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc       76.00, Rep      114.00 Dev...      38.00 Deg.
http://www.pet2008.cn/index.php?fromuid=11277
7楼2008-08-27 14:27:28
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gujm516

金虫 (小有名气)

真的是对称代码错了,但是没看到CIF还一时改不过来。
8楼2008-08-27 14:45:45
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