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dingmei

新虫 (初入文坛)

[求助] amber动力学RMSD值 已有1人参与

amber11 跑的小分子—蛋白复合物的动力学，如图，RMSD图在2ns-7ns已经很稳定了，按理说应该稳定了才对，但在8ns后有明显的上升趋势，请问各路大神这是什么缘故呢？

amber动力学RMSD值
9ns.png
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1楼 2015-09-06 15:19:44
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houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dingmei: 金币+2, ★有帮助 2015-09-09 15:39:43
跑的时间不够长，2-7ns并不是真正的稳定。
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2楼2015-09-06 20:34:12
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dingmei

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by houxuben at 2015-09-06 20:34:12
跑的时间不够长，2-7ns并不是真正的稳定。

这RMSD值已经到4了，会不会有问题？
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3楼2015-09-07 08:40:21
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