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Litter_horsr银虫 (小有名气)
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CLNEB计算过渡态的问题 已有1人参与
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参照说明书，我做了在氧化镓表面吸附H2的过程过渡态 由于已经有文献给出H2吸附在表面时，它的稳定结构，所以就没有再去过多的考虑可能的吸附情况，直接采用最稳定结构作为终态进行优化。初始态是H2分子物理吸附在表面，距离表面高度为0.7A 优化和Clneb时候的IBCAR设置: 优化时： SYSTEM=GaO ENCUT=480 ISTART=0 ICHARG=2 ISMEAR=0 SIGMA=0.02 NSW=500 IBRION=2 ISIF=2 EDIFF=1E-5 EDIFFG=-0.01 NELM=180 LORBIT=0 POTIM=0.08 PREC=Accurate 初态和终态的结构优化之后，插入四个镜像 。00-05 SYSTEM=GaO ENCUT=480 ISTART=0 ICHARG=2 ISMEAR=0 SIGMA=0.02 NSW=500 ISIF=2 EDIFF=1E-5 EDIFFG=-0.1 NELM=180 LORBIT=0 PREC=Accurate #for Clneb IBRION=3 POTIM=0 IOPT=0 ICHAIN=0 LCLIMB=.TURE. SPRING=-5 IMAGES=4 结果能够运行，但是一直优化不完，最后一步的时候提示： 500 F= -.24183396E+03 E0= -.24183396E+03 d E =0.334694E-09 quench: g(F)= 0.000E+00 g(S)= 0.000E+00 dE (1.order)= 0.000E+00 writing wavefunctions real 28323.73 user 450211.62 sys 342.69 Sat Sep 5 17:00:42 CST 2015 并且查看原子间力的时候，有如下（nebef.pl脚本） 0 0.000000 -241.833900 0.000000 1 0.000000 -240.388700 1.445200 2 0.000000 -239.776100 2.057800 3 0.000000 -240.928700 0.905200 力全部为0…… 请问： 1、过渡态计算为什么不收敛？ 2、利用CLNEB主要采用力作为收敛条件，但是这个力全部为0.怎么解决？ |
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10楼2016-05-10 09:46:17
阿克飞顿
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Litter_horsr: 金币+10, ★有帮助 2015-09-06 09:47:19
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任务提交命令有问题，你是在超算中心算的还是自己的服务器上，VTSY脚本编译进去了吗 发自小木虫Android客户端 |
2楼2015-09-06 09:30:41
阿克飞顿
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3楼2015-09-06 09:30:53
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cenwanglai: 金币+2, 谢谢~ 2015-09-06 10:03:02
cenwanglai: 金币+2, 谢谢~ 2015-09-06 10:03:02
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这是我在超算中心的提交方法，你如果已经编译VTST脚本了，参照我的方法做一下改动试试 1）vasp和vasp-vtsts早加入到环境变量设置文件.bash_profile中了 2）提交vasp的计算脚本： bsub -J job_name -q q_x86_kanglh -n 48 -o log.txt?~/apps/vasp/5.3.2/x86_64/bin/vasp 3）提交vasp-vtst的计算脚本： bsub -J job_name -q q_x86_kanglh -n 48 -o log.txt ~/apps/vasp-vtst/5.3.2/x86_64/bin/vasp-vtst 发自小木虫Android客户端 |
4楼2015-09-06 09:33:46