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Z&D

铁虫 (小有名气)

[求助] PlantCARE植物启动子分析 已有1人参与

我想问问PlantCARE这个在线分析植物启动子软件权威吗?有没有什么分析启动子更权威的软件尼?
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未来的我一定会感谢现在拼命的自己!
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崔柴柴

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-09-05 20:07:15
softberry的TSSP(http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=tssp&group=programs&subgroup=promoter)预测植物启动子。还有PLACE(https://sogo.dna.affrc.go.jp/cgi-bin/sogo.cgi?sid=& ...

请问sotfberry TSSP的预测结果该怎样看呀,搜索了好久也没有找到相关的参数描述~完全是一脸懵呀
4楼2018-08-27 18:35:06
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Z&D: 金币+2 2015-09-08 00:37:43
softberry的TSSP(http://linux1.softberry.com/berr ... p;subgroup=promoter)预测植物启动子。还有PLACE(https://sogo.dna.affrc.go.jp/cgi ... p;amp;page=newplace)。因为启动子结构相对复杂,更难预测,所以一般并没有说哪一个最权威,这几个经常都被用到,相互验证补充。还有一个MEME的网站。
2楼2015-09-05 20:07:15
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Z&D

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-09-05 20:07:15
softberry的TSSP(http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=tssp&group=programs&subgroup=promoter)预测植物启动子。还有PLACE(https://sogo.dna.affrc.go.jp/cgi-bin/sogo.cgi?sid=&lang=en ...

好的,谢谢!
未来的我一定会感谢现在拼命的自己!
3楼2015-09-08 00:38:18
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