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Z&D

铁虫 (小有名气)

[求助] PlantCARE植物启动子分析 已有1人参与

我想问问PlantCARE这个在线分析植物启动子软件权威吗？有没有什么分析启动子更权威的软件尼？
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未来的我一定会感谢现在拼命的自己！
1楼 2015-09-03 18:19:02
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Z&D: 金币+2 2015-09-08 00:37:43
softberry的TSSP（http://linux1.softberry.com/berr ... p;subgroup=promoter）预测植物启动子。还有PLACE（https://sogo.dna.affrc.go.jp/cgi ... p;amp;page=newplace）。因为启动子结构相对复杂，更难预测，所以一般并没有说哪一个最权威，这几个经常都被用到，相互验证补充。还有一个MEME的网站。
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2楼2015-09-05 20:07:15
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Z&D

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-09-05 20:07:15
softberry的TSSP（http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=tssp&group=programs&subgroup=promoter）预测植物启动子。还有PLACE（https://sogo.dna.affrc.go.jp/cgi-bin/sogo.cgi?sid=&lang=en ...

好的，谢谢！
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未来的我一定会感谢现在拼命的自己！
3楼2015-09-08 00:38:18
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崔柴柴

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-09-05 20:07:15
softberry的TSSP（http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=tssp&group=programs&subgroup=promoter）预测植物启动子。还有PLACE（https://sogo.dna.affrc.go.jp/cgi-bin/sogo.cgi?sid=& ...

请问sotfberry TSSP的预测结果该怎样看呀，搜索了好久也没有找到相关的参数描述~完全是一脸懵呀
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4楼2018-08-27 18:35:06
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