24小时热门版块排行榜    

查看: 7782  |  回复: 3

Ivy尘

新虫 (正式写手)

[求助] 急等回答:要测转录组,RNA的 OD260/230特别低行不行啊 已有2人参与

如图,因为自己提取的RNA总是有残留,直接委托测序公司一起提取。返回的结果如下
急等回答:要测转录组,RNA的 OD260/230特别低行不行啊
急等回答:要测转录组,RNA的 OD260/230特别低行不行啊-1
急等回答:要测转录组,RNA的 OD260/230特别低行不行啊-2
急等回答:要测转录组,RNA的 OD260/230特别低行不行啊-3

公司技术人员表示:
  1. D260/230太低也没关系,不用过多关心。
  2.RIN值>6.5就行。
  3.琼脂糖完整度还可以。
  4.最好直接建库,建库之后还可以检测建库质量,如果质量不好会从头再提取建库。

我表示很踌躇,本以为测序要求应该比普通逆转录要求高吧,普通逆转录都没法接受OD260/230那么低的。测序要经过mRNA富集,所以有机试剂残留没关系?有点担心残留会影响建库的质量,公司对建库的质量检测要求低于我的预期或者建库检测没问题而我关注的基因因此受到影响怎么办。。。。
求指教!!!!!!!!

附:
他们公司的RNA质量要求:
       样品的量:真核:总量≧6ug;原核:总量≧20ug。
  样品浓度:真核:浓度≧100ng/ul;
  样品纯度:OD260/280≧1.8;28S/18S≧1。
        RNA完整性:植物、真菌 RIN值≧6.5;动物 RIN值≧7.0;原核 RIN值≧6.0。
别个公司的:
       OD 260/280介于1.8-2.2之间,OD260/230≧2.0
       电泳检测28S:18S至少大于1.5;
       RIN值≧8.0;并确保RNA无降解,无污染
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Ivy尘: 金币+15, ★★★很有帮助 2015-09-01 17:03:13
个人感觉没问题,你这组数据可以进行测序。
2楼2015-09-01 16:31:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ivy尘

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-09-01 16:31:15
个人感觉没问题,你这组数据可以进行测序。

好的,谢谢!
3楼2015-09-01 17:03:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

幽幽深谷竹

金虫 (著名写手)

骨子里是文科男的理科男

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Ivy尘: 金币+15, ★★★很有帮助 2015-09-29 15:31:59
没问题的,RIN大于6.5,260/280大于1.8,样品就OK
我就是我IamwhatIam
4楼2015-09-23 22:39:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Ivy尘 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +15 koalala 2026-08-24 17/850 2026-08-24 14:16 by hhs666
[基金申请] 估计是周四 +4 archvillain 2026-08-18 4/200 2026-08-24 13:53 by zzuzxg
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 18/900 2026-08-24 12:03 by iaeyuan
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +6 炎黄贵胄 2026-08-22 7/350 2026-08-24 11:58 by 6543yes
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 明天应该可查了!? +4 chengyan1220 2026-08-23 4/200 2026-08-24 08:47 by gloomy6159
[基金申请] 什么时候开奖? +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见