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liashry

新虫 (小有名气)

[求助] 利用biacore得到的SPR曲线,选择何种模型进行拟合 已有1人参与

目前,利用biacore T200进行样品和蛋白的亲和力试验,得到如下spr曲线,
但是令我非常困惑的是,我们在选择拟合模型的时候,
如果用steady state模型拟合,则发现样品和蛋白Kd为100 M ,完全无亲和力,
但是用1:1 模型拟合时,样品和蛋白的亲和力较好,Kd可以达到nM级别,
所以请教各位大神,针对此曲线,我选择哪种模型比较合适?
另外评价模型的可靠性的参数有哪些呢?

利用biacore得到的SPR曲线,选择何种模型进行拟合
图片 1.jpg
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liashry

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Sureking at 2015-10-26 17:04:56
反应值低了点,有可能是假阳性的结果,建议用ITC验证一下。拟合的化,动力学拟合更合适一些,因为并没有完全解离,平衡态拟合并不太合适。

恩,谢谢您的建议,给了我很大的帮助,专家啊
3楼2015-10-27 08:59:32
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Sureking

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
liashry: 金币+8, ITC验证,很好的建议 2015-10-27 08:43:36
反应值低了点,有可能是假阳性的结果,建议用ITC验证一下。拟合的化,动力学拟合更合适一些,因为并没有完全解离,平衡态拟合并不太合适。
Sureking
2楼2015-10-26 17:04:56
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china_vv

新虫 (初入文坛)

生物狗一只,在其他实验室做了SPR,想测Kd的,但是不会处理数据,他们实验室也不太懂我这个小分子和蛋白的结合,请问您有什么资料吗?RU是怎么算的呢?方程用RU计算还是用信号强度Bmax呢?
门外汉,求助,恳请赐教!
4楼2018-09-16 11:42:20
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Du_Ke

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Sureking at 2015-10-26 17:04:56
反应值低了点,有可能是假阳性的结果,建议用ITC验证一下。拟合的化,动力学拟合更合适一些,因为并没有完全解离,平衡态拟合并不太合适。

可以教教我这个数据处理么?
5楼2018-09-20 22:57:08
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