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三磷酸腺苷铁杆木虫 (职业作家)
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[交流]
关于CpG岛与基因的表达调控
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| 如果一个基因的promoter或者exon1的CpG island发生了高度甲基化，是不是意味着这个基因的表达量就一定很低？ |
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呵呵
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xyklmu(金币+3,VIP+0):积极交流奖
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原则上是吧.甲基化可能造成转录水平的抑制,可以用real time PCR或者Northern检测目的基因表达量。 有段英文说明解释原理，你可以看一下 Epigenetic modifications, most importantly DNA methylation events, are frequently involved in transcriptional changes in both tumor suppressor genes and oncogenes. Methylation of cytosine at CpG dinucleotides is a common feature of a higher eukaryotic genomes. DNA methylation in the promoter regions of genes is generally correlated with gene silencing. Two underlying mechanisms have been identified. First, binding of transcription factors or enhancer blocking elements, such as CTCF, may be inhibited by DNA methylation. The second and more general mechanism involves proteins that detect methylated DNA through methyl CpG-binding domains (MBDs). Four of these proteins桵BD1, MBD2, MBD3, and MeCP2梙ave been implicated in methylation-dependent repression of transcription. These proteins mediate recruitment of repressor complexes that include histone deacetylases (HDACs). HDACs remove acetyl groups from lysine residues of histones H3 and H4 that results in condensation of chromatin and thus limit access of transcription factors to promoter regions of genes localized nearby. [ Last edited by 克隆大虾 on 2008-8-24 at 12:05 ] |
2楼2008-08-24 19:02:20
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4楼2008-08-27 03:59:12
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