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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 药理学 » 已知一个天然产物，如何寻找它的作用靶点
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rego_wang

新虫 (小有名气)

[求助] 已知一个天然产物，如何寻找它的作用靶点 已有2人参与

已经知道一个天然产物，有很强的细胞毒性(nM水平)，如何寻找它的作用靶点？有什么策略或者好的方法，求各位有经验的虫友给些建议～～感谢！！
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1楼 2015-08-31 15:38:53
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gxzhou

木虫 (正式写手)
药效都没做。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2015-09-01 06:45:26
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rabit5522

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
ipa数据库查询，可以给予一定提示

发自小木虫Android客户端
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3楼2015-09-01 07:50:00
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rego_wang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by rabit5522 at 2015-09-01 07:50:00
ipa数据库查询，可以给予一定提示

IPA针对已发表的，有研究基础的的化合物可以查的很详细，但是对于之前没有人研究过的化合物无从查起啊
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4楼2015-09-01 09:33:41
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rabit5522

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

如果你要求这么详细。那你就用pull down的方法，可以保证你找到几乎所有可与化合物结合的靶点蛋白

发自小木虫Android客户端
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5楼2015-09-01 12:03:09
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rego_wang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by rabit5522 at 2015-09-01 12:03:09
如果你要求这么详细。那你就用pull down的方法，可以保证你找到几乎所有可与化合物结合的靶点蛋白

这个办法也很好
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6楼2015-09-01 14:19:59
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mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
GST pull-down实验是一个行之有效的验证酵母双杂交系统的体外试验技术,近年来越来越受到广大学者的青睐。

其基本原理是将靶蛋白-GST（Glutathione-S-transferase谷胱苷肽巯基转移酶）融合蛋白亲和固化在谷胱甘肽亲和树脂上,作为与目的蛋白亲和的支撑物,充当一种“诱饵蛋白”,目的蛋白溶液过柱,可从中捕获与之相互作用的“捕获蛋白”(目的蛋白),洗脱结合物后通过SDS-PAGE电泳分析,从而证实两种蛋白间的相互作用或筛选相应的目的蛋白,“诱饵蛋白”和“捕获蛋白”均可通过细胞裂解物、纯化的蛋白、表达系统以及体外转录翻译系统等方法获得。此方法简单易行,操作方便。
GST pull-down技术
　GST：谷胱甘肽巯基转移酶(glutathione S-transferase)
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mgfudan
7楼2015-09-01 19:42:51
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mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan

【答案】应助回帖

可以用你的小分子替代其中一个蛋白进行洗脱分析，既可以获得初步结果。
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mgfudan
8楼2015-09-01 19:45:09
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rego_wang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by mgfudan at 2015-09-01 19:45:09
可以用你的小分子替代其中一个蛋白进行洗脱分析，既可以获得初步结果。

想要知道与小分子结合的蛋白有哪些，GST-小分子，一起pulldown下来的蛋白需要进行质谱鉴定，拿到一堆的蛋白质序列 ，是这个意思么？
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9楼2015-09-02 09:29:06
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mgfudan

铁杆木虫 (著名写手)

mgfudan
引用回帖:
9楼: Originally posted by rego_wang at 2015-09-02 09:29:06
想要知道与小分子结合的蛋白有哪些，GST-小分子，一起pulldown下来的蛋白需要进行质谱鉴定，拿到一堆的蛋白质序列 ，是这个意思么？...

基本如此。
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mgfudan
10楼2015-09-02 09:58:24
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