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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 用什么工具分析蛋白质的功能分类？
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wuer413023

至尊木虫 (文坛精英)

没事领金币

[交流] 用什么工具分析蛋白质的功能分类？

各位大侠，我想大规模分析分泌蛋白的功能分类，除了NCBI的COG（cluster of orthologous group, COG）功能分类之外，还有哪些工具或软件可以分析的？似乎PIR（The Protein Information Resource）数据库可以，但不知从哪里递交序列，如何分析，请大家不吝赐教..................或者其他的工具也可以介绍一下！谢谢！
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上邪!我欲与君相知，长命无绝衰。山无陵，江水为竭，冬雷震震，夏雨雪，天地合，乃敢与君绝！
1楼 2015-08-27 15:45:45
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hualinsixian

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主的问题解决了吗？最近我也碰到了类似的情况，有500多种蛋白急需分类，楼主最后用的什么软件，希望得到楼主的指点，谢谢！！
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9楼2016-08-15 20:20:54
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evangelina

无虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
wuer413023: 金币+2, 谢谢啊，这个好像原核生物可不可以啊？ 2015-08-27 18:57:43
我不知道你做的是不是人或者鼠的蛋白，如果是，STRING这个网站我们经常用

string-db.org
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2楼2015-08-27 18:26:35
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wuer413023

至尊木虫 (文坛精英)

没事领金币
引用回帖:
2楼: Originally posted by evangelina at 2015-08-27 18:26:35
我不知道你做的是不是人或者鼠的蛋白，如果是，STRING这个网站我们经常用

string-db.org

我做的是微生物的，string这个不是分子互作的吗？
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上邪!我欲与君相知，长命无绝衰。山无陵，江水为竭，冬雷震震，夏雨雪，天地合，乃敢与君绝！
3楼2015-08-27 18:52:26
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wuer413023

至尊木虫 (文坛精英)

没事领金币
引用回帖:
6楼: Originally posted by 果小胖子 at 2015-08-31 17:01:36
GO可以么？

GO可以批量处理吗，我的数据可能比较多
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上邪!我欲与君相知，长命无绝衰。山无陵，江水为竭，冬雷震震，夏雨雪，天地合，乃敢与君绝！
7楼2015-08-31 17:53:05
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