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wuer413023

至尊木虫 (文坛精英)

没事领金币

[交流] 用什么工具分析蛋白质的功能分类?

各位大侠,我想大规模分析分泌蛋白的功能分类,除了NCBI的COG(cluster of orthologous group, COG)功能分类之外,还有哪些工具或软件可以分析的?似乎PIR(The Protein Information Resource)数据库可以,但不知从哪里递交序列,如何分析,请大家不吝赐教..................或者其他的工具也可以介绍一下!谢谢!
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上邪!我欲与君相知,长命无绝衰。山无陵,江水为竭,冬雷震震,夏雨雪,天地合,乃敢与君绝!
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evangelina

无虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
wuer413023: 金币+2, 谢谢啊,这个好像原核生物可不可以啊? 2015-08-27 18:57:43
我不知道你做的是不是人或者鼠的蛋白,如果是,STRING这个网站我们经常用

string-db.org
2楼2015-08-27 18:26:35
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wuer413023

至尊木虫 (文坛精英)

没事领金币

引用回帖:
2楼: Originally posted by evangelina at 2015-08-27 18:26:35
我不知道你做的是不是人或者鼠的蛋白,如果是,STRING这个网站我们经常用

string-db.org

我做的是微生物的,string这个不是分子互作的吗?
上邪!我欲与君相知,长命无绝衰。山无陵,江水为竭,冬雷震震,夏雨雪,天地合,乃敢与君绝!
3楼2015-08-27 18:52:26
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wuer413023

至尊木虫 (文坛精英)

4楼2015-08-29 13:33:18
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wuer413023

至尊木虫 (文坛精英)

5楼2015-08-31 15:28:57
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果小胖子

铜虫 (初入文坛)


wuer413023: 金币+1, 谢谢,欢迎交流啊! 2015-08-31 17:53:08
GO可以么?
6楼2015-08-31 17:01:36
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wuer413023

至尊木虫 (文坛精英)

没事领金币

引用回帖:
6楼: Originally posted by 果小胖子 at 2015-08-31 17:01:36
GO可以么?

GO可以批量处理吗,我的数据可能比较多
上邪!我欲与君相知,长命无绝衰。山无陵,江水为竭,冬雷震震,夏雨雪,天地合,乃敢与君绝!
7楼2015-08-31 17:53:05
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果小胖子

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by wuer413023 at 2015-08-31 17:53:05
GO可以批量处理吗,我的数据可能比较多...

好像不能做很细致的分析,具体该怎么弄我也不是特别清楚。可以加个生物信息群问问
8楼2015-09-01 19:22:11
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hualinsixian

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主的问题解决了吗?最近我也碰到了类似的情况,有500多种蛋白急需分类,楼主最后用的什么软件,希望得到楼主的指点,谢谢!!
9楼2016-08-15 20:20:54
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