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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 请教混合菌的菌落计数问题
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webwxs

木虫 (初入文坛)

[求助] 请教混合菌的菌落计数问题 已有8人参与

从污水处理厂筛到的能降解有机污染物的混合菌种，要求进行每个种类的单独计数，请问有什么好的或比较科学的方法？请提供一至两种，将来可用于发表论文而不会引起争议。平板计数当然可以用，但似乎更适合于纯种的菌落计数，对于混合菌种不太合适。请高手赐教！谢谢！
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不爱钻研，不爱学习
1楼 2015-08-27 15:39:53
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
最好的办法是FISH，设计2组特异性DNA探针，可以针对16s设计。
已经是最简单的方法了。
另外可以做等温扩增，但是要做2组
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5楼2015-08-28 08:52:13
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担担面拉皮

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
webwxs: 金币+1, ★有帮助 2015-08-28 08:52:55
针对混合菌种设计相应的探针，应用FISH技术进行观察哈。或者设计专门的引物，用qPCR进行定量，以16S rRNA gene为参照。
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2楼2015-08-28 06:08:44
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lxx22135

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
平板计数，加入抑菌物质如抗生素或使用某种菌特定的培养基，使每个平板只适合一种菌体生长，并结合菌落形态，分别计数即可。
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3楼2015-08-28 08:21:51
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webwxs

木虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 担担面拉皮 at 2015-08-28 06:08:44
针对混合菌种设计相应的探针，应用FISH技术进行观察哈。或者设计专门的引物，用qPCR进行定量，以16S rRNA gene为参照。

非常感谢您的提示。但是我认为这些方法适合于菌种的分类鉴定，对于菌落计数却不是非常合适，我们这里的难点是混合菌的准确计数问题。
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不爱钻研，不爱学习
4楼2015-08-28 08:43:03
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