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webwxs

木虫 (初入文坛)

[求助] 请教混合菌的菌落计数问题 已有8人参与

从污水处理厂筛到的能降解有机污染物的混合菌种,要求进行每个种类的单独计数,请问有什么好的或比较科学的方法?请提供一至两种,将来可用于发表论文而不会引起争议。平板计数当然可以用,但似乎更适合于纯种的菌落计数,对于混合菌种不太合适。请高手赐教!谢谢!
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不爱钻研,不爱学习
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fengjunchen

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

fish好用。如果知道具体有哪些菌,可以查选择性培养基。

发自小木虫Android客户端
11楼2015-08-31 10:10:17
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担担面拉皮

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
webwxs: 金币+1, 有帮助 2015-08-28 08:52:55
针对混合菌种设计相应的探针,应用FISH技术进行观察哈。或者设计专门的引物,用qPCR进行定量,以16S rRNA gene为参照。
2楼2015-08-28 06:08:44
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lxx22135

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
平板计数,加入抑菌物质如抗生素或使用某种菌特定的培养基,使每个平板只适合一种菌体生长,并结合菌落形态,分别计数即可。
3楼2015-08-28 08:21:51
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
最好的办法是FISH,设计2组特异性DNA探针,可以针对16s设计。
已经是最简单的方法了。
另外可以做等温扩增,但是要做2组
5楼2015-08-28 08:52:13
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担担面拉皮

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by webwxs at 2015-08-28 08:43:03
非常感谢您的提示。但是我认为这些方法适合于菌种的分类鉴定,对于菌落计数却不是非常合适,我们这里的难点是混合菌的准确计数问题。...

那么这些菌落的形态大小是否一致,如果大小上有区别的话可以进行流式细胞仪进行分选计数哈
8楼2015-08-28 22:02:44
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担担面拉皮

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
webwxs: 金币+2, ★★★很有帮助 2015-08-31 16:07:01
另外,可以根据这些菌的大小特征进行流式细胞仪分选,再统计数量。
9楼2015-08-28 22:04:27
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lxl0314

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
确定菌后,选择特定的培养基

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
10楼2015-08-29 12:09:49
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lola1122

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我也遇到这个问题,要测土壤中木霉的活菌数,但是土壤中细菌数量也很多。给的方法是用查氏培养基,涂布测定,不知道行不行
12楼2015-08-31 16:15:33
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realpal00147

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

imagej软件,具体操作百度

[ 发自小木虫客户端 ]
14楼2015-08-31 16:37:38
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blue198651

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
webwxs: 金币+2, ★★★很有帮助 2015-09-01 16:00:38
引用回帖:
13楼: Originally posted by webwxs at 2015-08-31 16:21:33
菌种分类鉴定已经完成,需要的就是混合菌的计数问题。...

个人认为,计数实验还是要简单快速比较实用,因此分子生物学方法成本略高不宜采用,就按楼上建议的,针对你要计数的不同类型菌,采用特定的选择性培养基比较好。比如国标方法对食品中金黄色葡萄球菌计数、乳酸菌计数,都是这个原理。
15楼2015-09-01 07:45:47
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wt326

新虫 (初入文坛)

请问你找到方法了吗!  是确定混合菌的优势菌种同问??
17楼2015-09-18 20:40:56
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普通回帖

webwxs

木虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 担担面拉皮 at 2015-08-28 06:08:44
针对混合菌种设计相应的探针,应用FISH技术进行观察哈。或者设计专门的引物,用qPCR进行定量,以16S rRNA gene为参照。

非常感谢您的提示。但是我认为这些方法适合于菌种的分类鉴定,对于菌落计数却不是非常合适,我们这里的难点是混合菌的准确计数问题。
不爱钻研,不爱学习
4楼2015-08-28 08:43:03
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webwxs

木虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lxx22135 at 2015-08-28 08:21:51
平板计数,加入抑菌物质如抗生素或使用某种菌特定的培养基,使每个平板只适合一种菌体生长,并结合菌落形态,分别计数即可。

这里有个问题,有些菌类似,例如革兰氏阴性,代谢类型相似,这样的菌如何区分?
不爱钻研,不爱学习
6楼2015-08-28 08:52:28
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lxx22135

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by webwxs at 2015-08-28 08:52:28
这里有个问题,有些菌类似,例如革兰氏阴性,代谢类型相似,这样的菌如何区分?...

菌能确定是什么菌吗
7楼2015-08-28 10:42:09
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