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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 请教混合菌的菌落计数问题
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webwxs

木虫 (初入文坛)

[求助] 请教混合菌的菌落计数问题 已有8人参与

从污水处理厂筛到的能降解有机污染物的混合菌种，要求进行每个种类的单独计数，请问有什么好的或比较科学的方法？请提供一至两种，将来可用于发表论文而不会引起争议。平板计数当然可以用，但似乎更适合于纯种的菌落计数，对于混合菌种不太合适。请高手赐教！谢谢！
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不爱钻研，不爱学习
1楼 2015-08-27 15:39:53
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

fengjunchen

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

fish好用。如果知道具体有哪些菌，可以查选择性培养基。

发自小木虫Android客户端
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11楼2015-08-31 10:10:17
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担担面拉皮

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
webwxs: 金币+1, ★有帮助 2015-08-28 08:52:55
针对混合菌种设计相应的探针，应用FISH技术进行观察哈。或者设计专门的引物，用qPCR进行定量，以16S rRNA gene为参照。
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2楼2015-08-28 06:08:44
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lxx22135

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
平板计数，加入抑菌物质如抗生素或使用某种菌特定的培养基，使每个平板只适合一种菌体生长，并结合菌落形态，分别计数即可。
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3楼2015-08-28 08:21:51
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
最好的办法是FISH，设计2组特异性DNA探针，可以针对16s设计。
已经是最简单的方法了。
另外可以做等温扩增，但是要做2组
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5楼2015-08-28 08:52:13
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担担面拉皮

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by webwxs at 2015-08-28 08:43:03
非常感谢您的提示。但是我认为这些方法适合于菌种的分类鉴定，对于菌落计数却不是非常合适，我们这里的难点是混合菌的准确计数问题。...

那么这些菌落的形态大小是否一致，如果大小上有区别的话可以进行流式细胞仪进行分选计数哈
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8楼2015-08-28 22:02:44
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担担面拉皮

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
webwxs: 金币+2, ★★★很有帮助 2015-08-31 16:07:01
另外，可以根据这些菌的大小特征进行流式细胞仪分选，再统计数量。
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9楼2015-08-28 22:04:27
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lxl0314

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
确定菌后，选择特定的培养基

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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10楼2015-08-29 12:09:49
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lola1122

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我也遇到这个问题，要测土壤中木霉的活菌数，但是土壤中细菌数量也很多。给的方法是用查氏培养基，涂布测定，不知道行不行
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12楼2015-08-31 16:15:33
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realpal00147

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

imagej软件，具体操作百度

[ 发自小木虫客户端 ]
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14楼2015-08-31 16:37:38
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blue198651

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
webwxs: 金币+2, ★★★很有帮助 2015-09-01 16:00:38
引用回帖:
13楼: Originally posted by webwxs at 2015-08-31 16:21:33
菌种分类鉴定已经完成，需要的就是混合菌的计数问题。...

个人认为，计数实验还是要简单快速比较实用，因此分子生物学方法成本略高不宜采用，就按楼上建议的，针对你要计数的不同类型菌，采用特定的选择性培养基比较好。比如国标方法对食品中金黄色葡萄球菌计数、乳酸菌计数，都是这个原理。
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15楼2015-09-01 07:45:47
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wt326

新虫 (初入文坛)
请问你找到方法了吗！  是确定混合菌的优势菌种同问？？
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17楼2015-09-18 20:40:56
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普通回帖

webwxs

木虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 担担面拉皮 at 2015-08-28 06:08:44
针对混合菌种设计相应的探针，应用FISH技术进行观察哈。或者设计专门的引物，用qPCR进行定量，以16S rRNA gene为参照。

非常感谢您的提示。但是我认为这些方法适合于菌种的分类鉴定，对于菌落计数却不是非常合适，我们这里的难点是混合菌的准确计数问题。
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不爱钻研，不爱学习
4楼2015-08-28 08:43:03
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webwxs

木虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lxx22135 at 2015-08-28 08:21:51
平板计数，加入抑菌物质如抗生素或使用某种菌特定的培养基，使每个平板只适合一种菌体生长，并结合菌落形态，分别计数即可。

这里有个问题，有些菌类似，例如革兰氏阴性，代谢类型相似，这样的菌如何区分？
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不爱钻研，不爱学习
6楼2015-08-28 08:52:28
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lxx22135

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by webwxs at 2015-08-28 08:52:28
这里有个问题，有些菌类似，例如革兰氏阴性，代谢类型相似，这样的菌如何区分？...

菌能确定是什么菌吗
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7楼2015-08-28 10:42:09
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