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biogefart

木虫 (著名写手)

[交流] NcoI和SacI酶切问题

为什么切完联不上,难道有什么需要注意的地方?
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闹太套
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chysx6

铁杆木虫 (小有名气)

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0):thx
查了一下,都是很好用的酶,如果连不上
请考虑以下几点
1酶切是否完全
2连接酶是否好用,时间是否充足
3感受态效率
2楼2008-08-22 19:51:29
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xiaoyadxy

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
xyklmu(金币+3,VIP+0):感谢答复
还有很多细节问题也要考虑;比如
1.尽量选择相同的buffer,避免因buffer的不同造成其中一种酶活性很低的问题。需要注意的是,不同公司的限制酶的buffer体系是不相同的,交叉使用是很危险的。
2.保护碱基数目的问题。在设计PCR引物时,引入酶切位点后,常常要加入保护碱基,这是大家所熟知的。但是保护碱基数量多少,可能被新手所忽视。这种忽视可能会大大影响后续酶切的进行。  
一般情况下,普通的内切酶只加入两个保护碱基,其内切反应就可以正常进行;而有一类,仅仅只加入两个保护碱基,其内切反应就不能正常进行,这是因为内切酶不能正常结合DN段上。 NcoI 所需最少的保护碱基数是4 ,SacI 所需最少的保护碱基数是3 。
3楼2008-08-23 11:39:56
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